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马克斯普朗克生物化学研究所所长Matthias Mann是蛋白质组学研究领域的一位著名科学家,他在蛋白质组学质谱技术研究方面获得了许多重要的突出成果,改进或者发展了各种新型的技术,曾在Nature Methods,Cell等杂志上发表了一系列这一领域的研究成果。2019年Matthias Mann团队已报道研究Matthias Mann团队通过血浆蛋白组特征分析从而检测和避免生物标志物研究中样本相关性偏差Matthias Mann和Reudi Aebersold组联合发布4D-LFQ新的解决方案——diaPASEF重磅!Matthias Mann发文,基于捕获离子淌度的新一代4D 蛋白质组学MSB:血浆蛋白质组分析揭示新的非酒精性脂肪肝标志物Nat Commun:蛋白质组学研究揭示糖尿病引发β细胞线粒体代谢抑制的原因Cell Systems:血浆蛋白质组或可揭示胰岛素抗性之谜日前,国际知名期刊Cell Metabolism在线发表了Matthias Mann教授和丹麦哥本哈根大学Camilla Scheele的合作研究团队的最新研究成果,首次报道了针对棕色脂肪细胞的分泌蛋白质组学,并通过比较分析人类棕色和白色脂肪细胞分泌蛋白图谱,揭示了EPDR1是一种新型的棕色脂肪因子(Batokine)。肥胖是越来越被人们所关注的健康问题,预计到2040年,全球将会有5亿成年人受肥胖及其相关的慢...
发布时间: 2019 - 12 - 05
2019年12月1日,是第32个“世界艾滋病日”(World Aids Day)。艾滋病(AIDS)医学全称为“获得性免疫缺陷综合症(acquired immunodeficiency syndrome)”,是由人类免疫缺陷病毒(简称HIV)侵入人体后破坏人体免疫功能,最后导致被感染者死亡的一种严重传染病。自1981年世界第一例艾滋病病毒感染者发现至今,短短30多年间,艾滋病在全球肆虐流行,已成为重大的公共卫生问题和社会问题。2019年世界艾滋病日主题海报,来源: 疾病预防控制局根据中国疾病预防控制中心(CDC)的数据,2012年至2018年期间,我国艾滋病的新发例数和死亡人数均呈逐年上升趋势,2019年1-7月新发例数39483例,死亡数11454例。根据统计数据,估计新发感染者每年8万例左右,全人群感染率约为9.0/万。2012-2018年中国AIDS人数变化,数据来源:中国CDC艾滋病传播途径主要有性传播、血液传播、母婴传播三种。从传播途径来看,中国艾滋病防控工作取得显著成效,输血传播已基本阻断,经注射吸毒传播得到有效控制,母婴传播率处在历史最低水平。性传播是当前艾滋病的主要传播途径,占比超95%。体液(包括血液和精液等)是HIV病毒传播的主要载体,然而,HIV感染后的细胞外蛋白,尤其是外泌体蛋白的谱系尚未被系统地鉴定。今天介绍的这篇文章,于2019年11月1日在线发表于蛋白...
发布时间: 2019 - 12 - 03
阿尔茨海默症(Alzheimer Disease, AD)是一种神经退行性疾病,以胞外β-淀粉样蛋白(amyloid—β,Aβ)沉积和胞内神经纤维缠结为病理特征。近年来研究发现,AD患者脑内发生着明显的突触丢失的神经组织学改变,并多发生在认知缺失开始的早期。同时发现,突触的丢失程度与痴呆的严重程度密切相关,成为与认知缺失相关的一个重要的病理学特征。对突触功能障碍机制的深入研究可能为AD的早期干预和治疗开拓新的思路与方向。近日,蛋白质组学领域Top期刊Molecular & Cellular Proteomics在线发表题为“The proteome of the dentate terminal zone of the perforant path indicates presynaptic impairment in Alzheimer disease”的研究论文,研究者运用蛋白质组学技术方法对穿质通路的齿状回区域进行研究,阐明AD早期和认知缺失相关的突触功能障碍的分子机制。研究揭示在疾病早期,突触前的改变比突触后改变更重要。突触前蛋白可能是未来减缓或阻止认知功能下降相关治疗策略的关键,而鉴定到的特异性突触蛋白有可能成为AD突触功能障碍的靶点。显微解剖研究发现,穿质通路颗粒细胞的兴奋性突触在齿状回区域( Dentate Gyrus,DG ) 外三分之二...
发布时间: 2019 - 12 - 03
衰老(Aging)最显著的表型之一是骨骼肌力量的下降,这种现象发生在所有的衰老个体中,并导致下肢功能障碍和行动能力丧失。肌力下降的幅度大于肌肉质量下降的幅度,说明随着年龄的增长,每单位肌肉质量的收缩能力逐渐降低,但是肌肉收缩能力下降的原因尚不清楚。近期来自美国巴尔的摩国家健康研究所的研究人员在国际专业期刊eLife上发表了题为“Discovery proteomics in aging human skeletal muscle finds change in spliceosome, immunity, proteostasis and mitochondria”的文章,研究人员用年龄在20到87岁之间的健康人骨骼肌肉组织进行定量蛋白质组学分析,以此推断出骨骼肌中受衰老影响的分子通路,揭示衰老引发人体骨骼肌中剪接体、免疫调控、蛋白质稳态和线粒体改变,从而导致肌肉收缩能力下降。1健康骨骼肌样本定量蛋白质组学分析研究人员收集60名年龄在20岁至87岁之间的健康受试者骨骼肌活检样本(样本策略),进行TMT蛋白质组学定量分析(质谱策略)。结果表明,与年龄相关性最强的蛋白为LSM14同源蛋白A(LSm14A)、组织金属蛋白酶抑制剂3 (TIMP-3)和血清淀粉样蛋白P组分(APCS)。蛋白质表达的层次聚类结果表明,年轻人(20-34岁)和老年人(80岁以上)之间差异最大。图1、健康骨骼肌样...
发布时间: 2019 - 11 - 27
蛋白质翻译后修饰(Post-translational modification, PTM)是指蛋白质在翻译后的化学修饰,可调节蛋白质的活性、定位、折叠、以及蛋白与其他生物大分子间(包括蛋白、核酸、脂质等)相互作用。越来越多的研究发现,许多重要的生命活动不仅与蛋白质的丰度相关,更重要的是被各类蛋白质翻译后修饰所调控。近日,来自华中农业大学食品科学技术学院的邱宁课题组,在食品科学领域专业学术期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry连发三篇文章,结合蛋白质组学、磷酸化修饰组学、及N-糖蛋白质组学等方面,系统地阐明了鸡蛋蛋白在胚胎发育过程中的变化,并且首次鉴定了鸭蛋清中的N-糖蛋白,进一步从抗菌性以及致敏性角度提出糖基化差异对不同禽蛋功能的影响。据悉,邱宁课题组孟雅祺、朱方莉、孙浩浩分别为三篇文章的第一作者,景杰生物为该研究的蛋白质组学定量与翻译后修饰组学定量研究提供了技术支持。文章题目:Comparative Quantitative Phosphoproteomic Analysis of the Chicken Egg during Incubation Based on Tandem Mass Tag Labeling内容简介:蛋白质磷酸化作为一种普遍且重要的翻译后修饰,在蛋白质的转运、抗菌、抗氧化等方面具有重要作用。为了...
发布时间: 2019 - 11 - 20
脓毒症(Sepsis)是指由感染引起的全身炎症反应综合征,是一种微生物感染所引发的宿主反映失调的病症。脓毒症可导致血管功能障碍、器官衰竭甚至死亡,已成为ICU患者死亡的最重要原因之一。多器官衰竭是严重脓毒症的主要特征。然而为什么有些器官会在患者感染后更易发生功能失调甚至衰竭,其分子机制仍然不甚明了。血管是各器官和血液的中间屏障,是研究脓毒症所引起的器官衰竭的重要切入点。不同的血管床可能由于其独特的细胞表面蛋白组和糖组构成,表现出对脓毒症因子的不同相应。糖萼是血管内皮屏障的重要组成部分,是覆盖于血管内皮细胞表面的多糖蛋白复合物的总称。然而,由于缺乏对活体内血管内皮糖萼的分子构成的理解以及有效的检测手段,之前的研究很难去深入观测脓毒症发生过程中血管表面蛋白组的真实反应及重构过程。2019年10月11日,美国California大学的研究人员在著名学术期刊Nature Communications上发表论文,利用体内化学标记和高通量质谱技术对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus , MRSA)脓毒症小鼠模型,进行多器官血管表面蛋白组检测,以揭开血管在全身炎症反应过程中的变化情况。最终作者发现,MRSA脓毒症引起了血管表面蛋白组的显著重构,且具有器官特异性。研究速读一、小鼠器官特异性/非特异性血管蛋白组作者首先采用...
发布时间: 2019 - 11 - 18
阿尔茨海默氏病 ( Alzheimer disease,AD) 是一类精神功能进行性丧失,发病进程缓慢、随着时间不断恶化的神经性疾病 。tau蛋白的淀粉样蛋白 (Aβ) 斑块是AD的主要病理标志 。 Aβ积累发生在AD的早期阶段,并在启动AD发病机理中起关键作用 。但是,大脑中 Aβ 早期沉积到临床症状发作之间存在多年的时间延迟,这必然会 导致诊断延迟。Aβ特异性正电子发射断层扫描 (PET) 配体的开发已成为AD诊断的关键突破。但是由于昂贵的费用、操作时间长以及增加辐射暴露等问题,PET并不是一种理想的方法。 之前的研究已报道过一些与脑淀粉样蛋白沉积有关的基于血液的生物标记物,这些有效的 生物标志物的不同组合可能会提高对脑Aβ沉积的诊断 。基于质谱的蛋白质组学方法能有效处理血浆蛋白组的高度复杂性,已被广泛用于筛选血液生物标记物。在这些基于质谱的蛋白质组学方法中,高度丰富的蛋白质阻碍了低丰度生物标志物候选物的检测。相应的去除高丰度蛋白的方法也有很多。此外,多重标记方法与基于质谱的蛋白质组学分析也已被广泛用于大批患者血浆蛋白组的有效定量。2019年10月9日,国际刊物 Progress In Neurobiology (IF=10.658)上发表韩国首尔国立大学医学院Inhee Mook Jung教授团队的最新文章, 研究通过对认知正常个体,M...
发布时间: 2019 - 11 - 15
前言And God said, ' Let there be light ', and there was light.---- Genesis 1:346亿年前,地球上一片死寂,毫无生命迹象;20亿年过去了,地球上的情况有了改观,已经出现了一些简单的单细胞生物,但是谈不上有生气。地球太孤寂了,好吧,来点生机吧,于是大气中氧气含量骤升,从5亿年前从1%增加到12%。而正是氧气,生命形态从单细胞过渡到多细胞,地球也就成为了一个独一无二的、生机勃勃的蓝色星球。对人类而言,氧气可能是维持生命最重要的要素,我们可以数日不饮不食,但是不可一刻无氧气。因此在某种程度上说氧是生命之光并不为过。自现代自然科学诞生以来,回顾氧气相关的研究进展,我们会发现这是一部探寻生命奥秘的历史,一段寻找生命之光的历程。适逢70周年国庆,一部《攀登者》的电影引爆影院。我们的登山队员们为了祖国的荣誉,搏命登上地球之巅---珠穆朗玛峰。攀登者持续面临着低氧,寒冷,狂风等常人难以想象的恶劣环境,而缺氧或许是他们面临的最大挑战。在珠峰上空气更加稀薄,单位体积下含氧量只有海平面的25%左右,意味着即使我们静止不动也总觉得喘不上气,何况还要在陡峭的岩壁上向上攀爬。在这种条件下,攀登者步履蹒跚,每前进一步都非常困难。氧气对我们如此重要,因此虽然研究氧气的历史却并不久远,只有两百多年的历史,但是氧气的发现意义重大,直接导致了近代化...
发布时间: 2019 - 11 - 12
蛋白表达水平和信号通路的异常是肿瘤最常见的特征,近些年来的研究表明,相比于仅通过基因组分析,蛋白组和修饰组包含了更多的基因无法识别的新信息,这一观察引出了蛋白基因组学的概念,综合多组学数据的分析能够更全面的认识肿瘤,也为肿瘤未来的精准治疗提供新的思路和方向。2019年10月31日,Cell在线发表了题为: Integrated Proteogenomic Characterization of Clear Cell Renal Cell Carcinoma 的 最新研究成果,来自西奈山伊坎医学院的王培、约翰霍普金斯大学的Hui Zhang和Daniel W. Chan (他们的研究重点是蛋白组学和免疫学技术在诊断、管理以及癌症了解方面的开发及应用)、密歇根大学的Marcin Cieslik和Alexey I. Nesvizhskii 并联合临床蛋白质组肿瘤分析协会 (CPTAC), 运用系统的蛋白基因组学方法深度揭示肾透明细胞癌病理特征 。肾细胞癌 是世界十大常见的癌症之一,其中75%为肾透明细胞癌 (clear cell renal cell carcinoma, ccRCC ) 并占据了肾细胞癌死亡的绝大部分,具有典型的Warburg表型。 为了阐明驱动透明细胞肾细胞癌 (ccRCC) 的功能模块失调,作者对未经处理的...
发布时间: 2019 - 11 - 12
近年来,肠道微生物研究是炙手可热的研究热点。研究表明,肠道菌群的代谢能够影响人类生物学的多重特性。因此越来越多的科学家着眼于肠道微生物对人体内各个器官、组织的影响,并且尝试通过精准的微生物定向干预措施改善健康状况,即通过改变肠道菌群的组成来达到改善和治疗疾病的目的。微生物定向食品(MDF)是指选择性地增加有益的人肠道微生物丰度及其表达功能,对微生物群落有显著而迅速的影响。但是,MDF的研发需要知道MDF的生物活性成分和微生物-微生物相互作用的机制。今天介绍的这篇文章,于2019年9月19日在线发表于国际顶级学术期刊Cell上,来自华盛顿大学圣路易斯医学院的研究团队,运用针对群落菌群基因表达的定量蛋白质组学分析、宏蛋白质组学等方法,靶向筛选特定人类肠道微生物的营养来源。文章还报道了一种基于荧光磁性微球,可直接检测不同肠道微生物在体内处理相同营养物质的能力的方法,可作为生物传感器来破译肠道菌群成员如何争夺或协作这些纤维成分。研究发现肠道微生物种群间的竞争,从而决定了肠道菌群对饮食纤维的选择性效应。研究速读1.体内靶向筛选特定人类肠道微生物纤维制剂为了了解哪种类型的纤维能促进人体肠道中不同类型有益微生物及其活性成分的生长,研究人员使无菌小鼠定殖来源于健康 人体肠道的细菌菌株集合体,并喂食34种 食品级纤维食物。 接下来,研究人员筛选了144种含有不同类型和数量纤维补充剂的衍生饮食 (图 ...
发布时间: 2019 - 11 - 06
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