市场与支持 News
SUMO化修饰是一种普遍存在、动态可逆的蛋白翻译后修饰类型,虽然修饰过程与泛素化过程很相似,又称为“小泛素化”,但是SUMO化修饰具有与泛素化修饰截然不同的功能。泛素化修饰的靶分子主要被蛋白酶体降解,而SUMO化修饰介导靶分子定位与功能调节。SUMO化循环过程与泛素化循环过程相似,包括活化、结合、连接、修饰和解离等过程,其修饰过程涉及SUMO活化酶(E1,包括Aos1和Uba2)、SUMO结合酶(E2,包括Ubc9)和SUMO连接酶(E3,包括PIAS、RanBP2和PC2)。PIAS1(protein inhibitor of activated STAT1)蛋白是一种可以抑制信号转导与转录激活子1(STAT1)的特异性抑制蛋白,同时具有SUMO连接酶E3的活性,参与多种转录因子的活性调控和多种蛋白质的SUMO化修饰。PIAS1在肿瘤细胞的生长进程中具有关键作用,并可因不同类型的肿瘤而发挥促进或抑制肿瘤进展的作用,是癌症治疗的一个重要潜在靶点,并可作为抗炎因子调节炎症细胞粘附和抑制炎症损伤。在肺癌、前列腺癌、乳腺癌、淋巴瘤等肿瘤中,PIAS1可以通过促进DNA修复,促进肿瘤细胞的增殖和转移,抑制肿瘤细胞的凋亡等作用,正向调控肿瘤的发生发展。而在依赖MAPK信号途径激活而实现细胞快速增殖的肿瘤,如胃癌、结肠癌等中,PIAS1可通过抑制MAPK信号途径从而抑制肿瘤的进一步发生发展。然...
发布时间: 2020 - 02 - 28
肿瘤细胞转移进入颅内结构和脑脊液是晚期黑色素瘤最严重的并发症之一。多达5-7%的黑色素瘤患者会出现软脑膜黑色素瘤转移,这些患者的预后很差,通常平均存活8-10周。当前对于软脑膜黑色素瘤转移(Leptomeningeal Melanoma Metastases,LMM)患者的脑脊液(cerebrospinal fluid,CSF)环境几乎一无所知,难以制定有效的治疗策略。日前,国际专业学术期刊Clinical Cancer Research( IF=8.911)在线发表了美国佛罗里达州坦帕市莫菲特癌症研究中心团队的最新研究成果“Proteomic analysis of CSF from patients with leptomeningeal melanoma metastases identifies signatures associated with disease progression and therapeutic resistance”。 研究人员运用系统的蛋白质组学方法对来自软脑膜黑色素瘤转移(LMM)患者的脑脊液样本进行了分析,研究首次发现LMM患者的脑脊液与没有LMM的患者在生物学上是不同的。研究指出LMM微环境的了解将有助于开发能够延缓疾病进展的新治疗策略。此篇文章中,研究人员对来自黑素瘤软脑膜转移患者的脑脊液标本进行了分析。使用TMT标记蛋白质组学定量技术来...
发布时间: 2020 - 02 - 17
2019年诺贝尔生理学或医学奖授予了在细胞感知和适应低氧(称为hypoxia)领域取得突出贡献的三位科学家。越来越多的研究显示,低氧参与到包括肿瘤,感染,局部缺血和炎症等疾病的发生发展中。图片来源:诺奖官网低氧诱导因子1α(HIF1α)是应答低氧调控的关键转录因子,它在低氧条件下表达稳定并能入核调控下游基因的表达。除此之外,炎性因子和微生物感染能激活免疫细胞并诱导糖酵解发生,同时也会活化HIF1α[1]。已有的研究表明,在巨噬细胞和树突状细胞的炎症激活过程中,HIF1α和糖酵解途径的代谢物能够促进炎症。同时,低氧和炎症激活伴随的糖酵解通路活化能够增加乳酸的产生和释放并促进细胞外环境的酸化,而高浓度的乳酸可以转运到细胞内作为底物被代谢。细胞感知和适应氧气变化机制示意图之前的研究表明,乳酸会增加T helper 1细胞的分化和干扰素γ(IFNγ)的产生[2]并促进肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的M2样极化以及VEGF表达[3],因此有研究者提出假设,乳酸是否可能通过多种机制抵消HIF1α和糖酵解代谢产物所带来的炎症反应进而促进细胞稳态?令人兴奋的是,关于该假设的研究近些年来取得了突破性的进展。2019年12月9日,免疫学领域专业期刊Nature Reviews Immunology 以“Year in Review”系列专题形式,发表题为The hypoxia–lactate ...
发布时间: 2020 - 02 - 14
O-糖基化修饰(O-GIcNAc)是一种动态可逆的、普遍存在的蛋白质翻译后修饰,广泛参与到诸如转录调控、细胞代谢、信号转导、蛋白降解等生物进程。糖基化蛋白通常位于细胞表面且容易分泌到循环系统中,具有作为疾病诊断生物标志物的巨大潜力。近日,来自国家蛋白质科学中心( 北京)、中国军事科学院军事医学研究院生命组学研究所钱小红团队、秦伟捷团队合作,发表了一种新的集成数据处理策略,基于参考库的MS1特征匹配和MS2识别传播,可快速识别、高深度和可重现的无标记的人类尿液O-糖基化定量蛋白质。这种策略将数据库搜索速度提高了20倍,并使单个样品中完整O-糖肽定量提高了30%-40%,重现性明显提高。运用该集成数据处理策略,作者共在36个健康的人类尿液样本中鉴定出1300个完整的O-糖肽,缺失数据量减少了30%-40%。这是目前尿O-糖蛋白组学的最大数据集,证明了这种新策略在大规模临床研究中的应用潜力。相关研究成果发表在专业学术期刊Analytical Chemistry上。尿液样本糖基化组学分析流程图糖基化作为最复杂的蛋白质翻译后修饰之一,蛋白质组中丝氨酸和苏氨酸残基的广泛存在,以及数十种不同的O-聚糖类型,导致糖基化的数据库搜索需要非常长的时间。搜索典型的尿液O-糖蛋白组的原始MS文件包含120多个MS2谱图,需要花费120多个小时,即使将O-糖肽谱图整理出来,仍需要60个小时。除此之外,由于完...
发布时间: 2020 - 02 - 13
众所周知,已知长期高盐饮食会增加患高血压的风险,进而发展导致心血管疾病和慢性肾脏疾病。高血压与肾病存在密切联系,一方面,肾脏实质性病变和肾动脉病变导致血压升高,这种关联性疾病在继发性高血压中称为肾性高血压(renal hypertension)。另一方面,慢性肾脏疾病有三分之一由高血压导致,长期高血压将造成肾脏不可逆转的器质性损害,导致尿中蛋白质增加,从而引发高血压肾病(hypertensive renal disease)。不管是患有肾病还是患有高血压都会有可能诱发另一种疾病的出现,但人们对其中的具体机制知之甚少。近日,在国际专业学术期刊Science Signaling上发表了一篇采用整合蛋白质组学联合分析的手段研究高血压-肾病转换的文章,德国科隆大学的Gary Siuzdak课题组对高盐饮食诱导的高血压模型大鼠肾脏组织进行蛋白质组学、磷酸化修饰组学和代谢组学分析,揭示了高血压引起肾小球硬化的代谢变化,包括在疾病早期阶段的脂质分解和激活贫血通路,提示通过饮食干预代谢能够有效防治高血压引起的肾脏疾病。研究速读1. DDS大鼠模型与非靶向代谢组学分析研究人员首先建立了一个具有高血压和蛋白尿特征的大鼠模型(Dahl salt-sensitive,DSS)。首先,研究者使DSS大鼠日常摄入4%的过量盐分,7天后仅观察到血压升,随后至21天血压持续上升并伴有肾损伤。对高盐饮食早期(7天)...
发布时间: 2020 - 02 - 13
线粒体肌病(mitochondrial Myopathy)是一种少见的,由于线粒体结构和(或)功能异常所导致的以肌肉受累为主的多系统疾病病。线粒体肌病以呼吸链的装配和功能缺陷为特征,线粒体DNA和细胞核DNA(nDNA)的突变是这些疾病的主要原因。虽然测序扩大了线粒体肌病的诊断范围,大大提高了线粒体肌病的诊断水平,但其潜在的病理生理机制仍知之甚少。2019年12月17日,国际知名期刊Cell Reports在线发表了马克斯普朗克生物化学研究所所长Matthias Mann团队与慕尼黑大学神经学系Thomas Klopstock团队的最新合作研究成果“Proteomics of Cytochrome c Oxidase-Negative versus -Positive Muscle Fiber Sections in Mitochondrial Myopathy”。研究人员运用基于质谱的蛋白质组学技术结合激光捕获显微解切割技术,对分离出的肌纤维进行蛋白质组学分析,系统揭示了线粒体肌病的病理机制。此篇文章中,研究人员运用激光捕获显微解切割技术捕获线粒体肌病活检个体(COX+和COX-)的肌纤维,结合蛋白质组学技术研究了线粒体肌病如何改变肌纤维蛋白组,以及不同的纤维类型如何应对受损的呼吸链活动,揭示了肌纤维在应对能量短缺和代谢压力时的代偿机制。1蛋白质组学工作流程研究人员使用最近描述的...
发布时间: 2020 - 02 - 07
1 月 9 号,国际专业学术期刊 Cell Metabolism(IF =22.415 )发表了题为Comprehensive Proteomics Analysis of Stressed Human Islets Identifies GDF15 as a Target for Type 1 Diabetes Intervention研究论文[1],西北太平洋国家实验室的 Thomas O. Metz 课题组运用蛋白质组学分析从人类胰岛中发现了 GDF15 对一型糖尿病的影响,GDF15为1型糖尿病干预的靶标。生长分化因子-15(Growth/differentiation factor 15,GDF15)是转化生长因子-β 超家族(TGFβ super family)的一员。此前 GDF15 被发现在创伤过后的多种器官出现明显的上调,被认为是不少疾病的标记物。2017 年前后,医学界进一步发现了它在肥胖治疗的潜力,获得了科学家的广泛关注[2]。一型糖尿病(T1D)是由β细胞加工性丧失引起的,该过程是由促炎性细胞因子信号传导传播的,破坏了促凋亡和抗凋亡蛋白之间的平衡。为了鉴定参与该过程的蛋白质,研究人员运用TMT蛋白质组定量技术(质谱策略),对用白介素-1β和干扰素-γ处理的人胰岛(样品策略)进行了全面的蛋白质组学研究,从中鉴定出11,324种蛋白质,经过处...
发布时间: 2020 - 02 - 06
新型高致病性冠状病毒(2019-nCoV)在中国的出现及其在国内和国际的迅速传播构成了全球卫生紧急情况。全国范围内各省陆续启动重大突发公共卫生事件一级响应,14亿人民众志成城,奋斗在这场看不见硝烟的战争之中。值得注意的是,技术的进步为疫情的防控提供了宝贵的时间和指导意义。1月10日,新型冠状病毒的基因组被破译。随后不久,2019-nCoV核酸检测试剂盒研制成功,应用于一线疫情防控。一项项科研成果的陆续取得,为我们奠定了坚决打赢疫情防控阻击战的信心。作为一种未知的新型病毒,2019 nCoV仍有诸多问题需要深入解决,并藉此开发更有效的治疗和预防手段。近年来,Nature、Cell等高水平学术期刊报道了科学家运用蛋白质组学技术开展的病毒学、致病病理学研究成果,对于此次肺炎疫情的进一步研究具有一定参考意义。病原体入侵包括几个基本的步骤:1,病原体和宿主细胞相互识别,通过内吞或者膜融合等方式进入到宿主细胞内;2,病原体与宿主细胞发生一系列的相互作用,病原体能够干扰宿主细胞的免疫系统、劫持宿主细胞的部分原件为病原体利用;3,实现病原体本身的复制、增殖和释放。病原体入侵的基本的步骤从这个角度出发,蛋白质组学技术可用于以下研究:(1)发现新的互作蛋白复合体;(2)解析病毒侵染前后宿主和病原体蛋白的表达和翻译后修饰变化;(3)解析侵染过程中的蛋白质动态时空分布变化。1.Nature:蛋白质组学揭示...
发布时间: 2020 - 02 - 03
不久前我们回顾了2019年度蛋白质组学领域的精选研究,在过去的一年里,数十篇蛋白质组学相关的研究应用见刊于CNS等顶级期刊,为生命科学与精准医学领域增添了浓墨重彩的一笔(详情请点击:硕果累累,2019年蛋白质组学精华研究盘点)。更加让人振奋的是,过去的几年,随着我国科研人员的不懈努力,再加上国家对蛋白质组学研究的稳步支持,中国蛋白质组学研究实现了跨越式的发展,高水平的研究论文层出不穷。今天,编者精选了2019年度,国内外华人学者在Cell、Science、Nature发表的蛋白质组与蛋白质修饰组学研究成果,以飨读者。排序按照发表时间,不分先后。中国人类蛋白质组计划发现肝癌精准治疗新靶点:Proteomics identifies therapeutic targets of early-stage hepatocellular carcinoma2019年2月28日,Nature在线发表了军事科学院军事医学研究院生命组学研究所、国家蛋白质科学中心(北京)、蛋白质组学国家重点实验室贺福初院士团队、钱小红教授团队联合复旦大学附属中山医院樊嘉院士团队等开展的早期肝细胞癌蛋白质组研究成果。研究首次描绘了早期肝细胞癌的蛋白质组表达谱和磷酸化蛋白质组图谱,发现了肝癌精准治疗的新靶点。点击图片查看详细解读研究人员运用蛋白质组学和磷酸化组学等技术,针对110个与乙型肝炎病毒感染相关的临床早期肝细胞...
发布时间: 2020 - 01 - 18
“蛋白组学·2019”线上文献阅读大赛开赛以来,陆续收到了很多参赛作品。经过评审团队精心的审阅、筛选,优秀参赛作品将陆续在“精准医学与蛋白组学”学术平台发布。此次活动由蛋白组学、修饰组学的领军企业——景杰生物独家支持,更多精彩活动,期待你的参与~~~参赛者:金梓婧 (上海交通大学基础医学院)参赛作品:全身性幼年特发性关节炎不同炎症表型的分子特征文章名称:Molecular signature characterisation of different inflammatory phenotypes of systemic juvenile idiopathic arthritis发表期刊:Ann Rheum Dis(IF=14.299)发表日期:2019年4月全身性幼年特发性关节炎(Systemic juvenile idiopathic arthritis, SJIA)是一种不明机制的自发炎症疾病,占幼年特发性关节炎(JIA)的10%-15%。国际类风湿学协会联盟对SJIA的判定标准是连续2周发热、短暂的皮疹以及慢性关节炎。然而在SJIA的早期,关节炎的症状表现得很少,甚至不存在。而其他的疾病,比如由感染引起的一些疾病,与SJIA有着相似的症状,这就使得SJIA的早期诊断难度大幅度增加。众所周知,早期的诊断是开展有效靶向治疗的重要方法,所以找到能够确诊早期SJ...
发布时间: 2020 - 01 - 15
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