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离子淌度分离概念的引入使得蛋白质组学进入了4D新时代。4D蛋白质组学是在3D分离即保留时间(retention time)、质荷比(m/z)、离子强度(intensity)这三个维度的基础之上增加了第四个维度,离子淌度(mobility)的分离(图1),并大幅度的提高扫描速度和检测灵敏度,带来蛋白质组学在鉴定深度、检测周期、定量准确性等性能的全面提升。图1. 新一代4D蛋白质组学示意图磷酸化是研究最广泛的翻译后修饰类型,在生长发育、信号转导以及包括癌症在内的各种疾病进程中都发挥着至关重要的作用。而随着科学的逐渐深入和技术的不断进步,基于质谱的磷酸化修饰组学也引起了人们越来越多的关注,并有力推动了磷酸化功能研究的进展。然而对于传统的质谱技术来说,要想实现磷酸化的深度和精确鉴定存在着两大挑战,1)生物样品中不同的磷酸化肽段丰度会呈现出几个数量级的差异,这需要更高的质谱扫描速度和灵敏度来鉴定到低丰度的磷酸化肽段;2)同一个肽段发生磷酸化位点的不同,会造成同分异构的磷酸化肽段,并且这些同分异构的磷酸化肽段大部分会在色谱上共洗脱,而传统蛋白组学质谱平台不能对这些共洗脱的同分异构肽段进行分离。现在得益于质谱技术的进步,采用基于Bruker timsTOF Pro平台的4D蛋白质组学技术,这两大问题都得到极大的改善,除了在蛋白质组分析方面展现出的极佳的灵敏度和覆盖深度,根据我...
发布时间: 2019 - 08 - 06
“2019景杰生物·首届4D蛋白质组学与生信分析培训班”于7月25日在杭州圆满落幕。35天紧张筹备,来自13个不同省市的培训学员,接连不断的精彩内容.......让我们一起步入其中,看看这场盛会台前幕后、原汁原味的精彩瞬间吧!全新一代,4D蛋白质组学!本次培训班以“全新一代4D蛋白质组学”为主要内容,也是国内首次举办的4D蛋白质组学主题培训班。在课程设置上,从4D蛋白质组学技术原理,到生信分析中极大提升蛋白质组学定量准确性的的4D对齐功能,都一一讲述介绍!在授课内容上,讲师们不厌其烦,三易其稿,数度试讲,是铆足了劲要惊艳全场。 强强联合,领航新时代!培训班邀请到景杰生物公司有多年蛋白质组学科研经验的生物学主管、首席生信分析师等众多资深技术牛人,传授独家绝技,还诚挚邀请到国际著名分析仪器制造商Bruker公司应用主管刘先明博士带来精彩的讲解,介绍了4D蛋白质组质谱平台timsTOF Pro在硬件上的一系列提升与显著进步。 景杰生物作为中国蛋白质组学与修饰组学的领军企业,率先引进Bruker timsTOF Pro质谱仪并开发推出4D蛋白质组学技术服务,将一如既往,以实打实的技术沉淀和前瞻精准的业务方向,为广大客户提供更加优质和完善服务,助力生命科学和医学领域的科学研究。 新益求新,内容精彩实用!课程聚焦蛋白质组学技术原理与应用,尤其着重对4D蛋...
发布时间: 2019 - 08 - 05
S-亚硝基化(S-nitrosylation)是一种基于氧化还原的蛋白质翻译后修饰,可调节多种生理和病理过程。类似于其他翻译后修饰,S-亚硝基化可通过改变蛋白构象,稳定性,亚细胞定位,生物化学活性和蛋白质-蛋白质相互作用的来调节蛋白的功能。一氧化氮(NO)是涉及动植物的各种发育过程和应激反应的关键信号分子,NO的主要生物活性通过S-亚硝基化反应将NO基团共价加到蛋白质的活性半胱氨酸巯基上形成S-亚硝基硫醇来实现。在高等植物对生物胁迫和非生物胁迫响应中,活性氧(ROS)和NO的爆发及其相互调节对于早期信号传导至关重要,其中S-亚硝基化已经显示出调节参与ROS稳态的关键酶的活性。S-亚硝基化和脱亚基化的动态过程主要由细胞内S-亚硝基谷胱甘肽(GSNO)的水平调节,GSNO可以被高度保守的GSNO还原酶(GSNOR)不可逆转地降解。2019年7月,山东农业大学史庆华教授课题组在国际权威期刊Plant and Cell Physiology发表了题为:Unravelling GSNOR-mediated S-nitrosylation and multiple developmental programmes in tomato plants的最新研究成果。图1. GRNOR介导的番茄植株发育作者运用蛋白质组学、S-亚硝基化修饰组学技术结合相应的生理生化实验方法,获得GSNOR介导的表型和...
发布时间: 2019 - 08 - 05
2019年7月23日,蛋白质组学top期刊Mol Cell Proteomics发表了中国科学院上海生物科学研究所植物生理与生态研究所赵国屏院士、赵维研究团队琥珀酰化修饰组学的文章,研究揭示了ScCobB2介导的链霉菌蛋白质合成和碳代谢调控机制。在本文的土壤链霉菌模型中,研究人员用生物化学方法将sirtuin样蛋白ScCobB2定义为去琥珀酰化酶。将∆ScCobB2与野生型菌体通过LC-MS/MS分析,结果表明在∆ScCobB2细胞中至少有114个蛋白存在明显的高琥珀酰化修饰调控,涵盖蛋白生物合成和碳代谢两种主要途径。此研究首次在细菌中发现了一种特异性的去琥珀酰化酶,并证明其在S. coelicor的多个生物学过程中具有关键的调控作用,为后续在其他微生物中琥珀酰化调控的研究奠定了基础。景杰生物为该文章的合作单位。蛋白质翻译后修饰(PTM)在细胞进程调控中扮演至关重要的角色,通过改变蛋白质的性质,如结构、稳定性、复杂的形成或酶活性而发挥作用。蛋白质中的20种氨基酸,赖氨酸是最常见的共价修饰的目标之一,可发生诸如泛素化,乙酰化,丙酰化, 丙二酰化, 巴豆酰化等修饰。通过这些修饰,含有赖氨酸的蛋白调控作用被大大拓宽。作为一个在真核生物中最近发现的蛋白质翻译后修饰,赖氨酸琥珀酰化修饰吸引了越来越多的关注,其功能涉及一些重要的细胞进程包括分解代谢,β-氧化和生酮作用。然而,由于在微...
发布时间: 2019 - 08 - 05
组蛋白是染色质基本结构核小体的重要组成部分,组蛋白上发生的多种诸如甲基化、乙酰化、磷酸化、巴豆酰化、琥珀酰化等修饰在肿瘤发生、个体发育、衰老等多种生理病理过程中都发挥着关键调控作用,是表观遗传学研究的核心热点。目前已报到的组蛋白修饰位点以及种类已经超过了400种。对组蛋白修饰的深入研究也越来越多的揭示组蛋白修饰在多种调控场景中的重要作用。2019年3月,Nature报道了来自美国西奈山医学院研究者关于组蛋白新型修饰5-羟色胺化,揭示了神经递质5-羟色胺能够进入细胞核使组蛋白发生5-羟色胺化,进而调控基因表达。 同月,Nature杂志报道了洛克菲勒大学David Allis教授团队联合普林斯顿大学Tom W. Muir教授团队在致癌组蛋白(oncohistone)方面的工作,揭示了完整的人类致癌组蛋白突变谱。证明了组蛋白序列点突变与肿瘤发生的关联。 对于组蛋白修饰的研究,在过去的20多年中,研究者应用LC-MS/MS生物质谱等不同的方法发现了组蛋白上超过20余种的修饰类型的存在;这些修饰不仅存在于组蛋白的游离N端,同时也有在组蛋白核心内部区域的位点被报道有修饰的发生,这些修饰通过直接或间接的方式影响染色质结构并招募特定的染色质结合蛋白实现基因表达调控。日前,来自上海科技大学的高冠军课题组与清华大学戴俊彪课题组共同在国际知名期刊Developmental&...
发布时间: 2019 - 08 - 05
值此重庆大学 90 周年校庆之际,为交流国内外植物功能基因组学和分子育种研究领域的最新进展,重庆大学生命科学学院、重庆市植物学会、重庆市遗传学会、重庆大学前沿交叉学科研究院共同举办“2019 植物功能基因组与分子育种青年学者论坛”于2019 年 7 月 13 日-15 日盛大开幕。作为蛋白质组学与翻译后修饰领域的领军企业,景杰生物倾情赞助此次会议,带来了完整的植物蛋白质组学研究方案,开启植物生物学研究新视野。论坛邀请了西南大学农学与生物科技学院院长何光华教授、浙江大学殷学仁教授、中国农业大学马男教授、中科院植物所李博强研究员,江苏大学食品与生物工程学院副院长张红印教授、中国农科院刘佳副研究员、重庆大学徐海洋教授、四川大学张阳教授等一大批国内在相关领域具有重要学术影响力的优秀学者,通过学术报告、讨论等形式,加强植物科学工作者之间的交流与合作、促进植物功能基因组学及分子育种学科的发展。近年来随着技术的不断进步,蛋白质组学逐步从方法学研究进入到了实际应用阶段,在植物生物学的研究中大放异彩。作为蛋白质组学与翻译后修饰领域的领军企业,景杰生物一直致力于推动蛋白质组学技术与运用的发展,本次受邀参加此次盛会,带来了完整的植物蛋白质组学研究方案:植物逆境胁迫、植物分子育种、4D-LFQ蛋白质组定量、高通量磷酸化等技术运用,吸引了与会师生的热烈咨询。
发布时间: 2019 - 07 - 17
2019年7月11日,首届“喀斯玛优选商家科院行——上海植生所科研品牌展”在中科院上海植生所如期举行。景杰生物作为国内蛋白质修饰类抗体的开拓者,与蛋白质组学、修饰组学的领跑者,2018年受邀入驻喀斯玛商城,凭借高品质的抗体产品、与周到的售前售后服务脱颖而出,得到了科研人员的极大的支持与信任。此次活动,景杰生物作为喀斯玛商城“优选商家”,也是唯一受邀参加的蛋白质修饰类抗体品牌商,相关产品与技术运用吸引了参会师生的广泛关注和高度赞扬。酷暑高温,前来咨询的科研人员依旧络绎不绝。景杰生物将继续秉承“科技创新,协同并进“的价值理念,继续推动蛋白质组学产品与技术的发展和转化应用,为医者及科研工作者提供更全面、更先进的服务,使得蛋白质组学技术能够惠及大众健康。
发布时间: 2019 - 07 - 17
2019年7月6日上午,中国植物生理与植物分子生物学学会(Chinese Society for Plant Biology,简称CSPB)第十二次会员代表大会暨全国学术年会在江西南昌隆重开幕。来自各省、自治区、直辖市会员代表、学会分支机构代表、科研院所及企业代表1200余人参加会议。中国植物生理与植物分子生物学学会成立于1963年10月,前身是中国植物生理学会,2010年3月更名为中国植物生理与植物分子生物学学会。目前在全国28个省、市及自治区,有地方性的植物生理、植物生物学学会或专业团体,拥有会员6000余人。学术年会每五年举办一次,是本学会重量级会议,是我国植物生物学领域前沿科研大会。此次会议大咖云集,学会理事长陈晓亚院士主持开幕式。学会名誉理事长、北京大学原校长许智宏院士等致开幕辞。出席开幕式的嘉宾还有:江西省农业大学党委书记黄路生院士,武汉大学高等研究院院长朱玉贤院士,中科院上海分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所所长韩斌院士,中科院上海分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所学术所长、中科院上海植物逆境生物学研究中心主任朱健康院士,中科院上海分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所林鸿宣院士,中科院遗传与发育生物学研究所基因组生物学研究中心主任曹晓风院士等嘉宾。大会开幕式大会以植物生理与绿色发展为主题,在两天半的时间里围绕植物激素与发育生物学、植物基因组...
发布时间: 2019 - 07 - 17
原发性中枢神经系统血管炎(PACNS)是主要局限于脑实质、脊髓和软脑膜的中小血管的罕见重度免疫炎性疾病。PACNS通常缓慢起病,少数也可急性起病,病程可有复发缓解,也可进行性加重。头痛、认知障碍以及持续性局灶神经功能缺损或脑卒中的是PACNS最常见的临床表现,也是70%以上PACNS患者的首发症状。偏瘫多见于较大血管受累患者,癫痫多见于儿童,部分成人患者可合并有淀粉样血管病。尽管广泛使用的免疫抑制剂可预防约80%的患者死亡,但这些药物通常伴有不良副作用。目前临床上对患者接受治疗后出现不同反应的原因未知,并且缺乏分子工具来辅助PACNS的临床研究,如何改善患者的预后是摆在大家面前的共同难题。近日,来自加州大学旧金山分校的Joe Derisi教授课题组在著名学术期刊Neurology (IF: 8.689)上发表该论文,Derisi教授的实验室之前擅长利用全基因组方法解决酵母分子生物学和人类传染病的问题,此次他们开创性地利用蛋白质组学技术手段分析比较了经活检证实的PACNS患者的CSF谱与非炎症对照(NICs)和可逆性脑血管收缩综合征(RCVS)对照的CSF谱。 他们的研究结果,清晰地揭示了PACNS慢性炎症病理生理学中涉及的候选蛋白和分子途径,并突出未来治疗和诊断研究的分子靶点。  文章研究目的及部分研究结论总结文献速读1、选取的临床病例背景情...
发布时间: 2019 - 07 - 17
为了共同探讨蛋白质组以及翻译后修饰组学的最新进展,推动其在生物医学等领域的转化应用,2019年6月30日,“中山看“景”:蛋白质修饰前沿论坛”在复旦大学附属中山医院圆满落幕。作为蛋白质组学以及蛋白质修饰组学领域的领军企业,杭州景杰生物科技有限公司有幸受邀与中山医院临床医学研究院联合举办此次会议。 此次论坛大咖云集,复旦大学生物医学研究院余红秀教授,上海交通大学基础医学院院长程金科教授,同济大学田志新教授,上海市中医肿瘤研究所所长贾立军教授,上海交通大学医学院附属仁济医院许杰教授,上海交通大学医学院附属瑞金医院王晓教授,上海交通大学医学院李斌教授,华东师范大学李晓涛教授,海军军医大学免疫学研究所陈涛涌教授,景杰生物高级质谱专家卜晨博士,景杰生物高级应用专家张曜辰博士等学者出席了本次论坛,并带来精彩报告。 复旦大学生物医学研究院余红秀教授带来《Sirt5在炎症和肿瘤中的功能与机制》的报告。报告指出巨噬细胞在被LPS激活后会大量消耗葡萄糖,糖酵解作用显著增强,表达M1型分子标志物并大量产生炎性因子IL-1β,其机制是糖代谢中间产物琥珀酸(Succinate)累积,琥珀酸稳定的Hif-1α加强了IL-1β的转录,揭示出修饰与免疫的重要关联。 上海交通大学基础医学院院长程金科教授带来《线粒体蛋白的SUMO修饰与代谢》的报告。报告指出SUMO化修饰能够修饰线粒体S...
发布时间: 2019 - 07 - 04
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