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食管鳞状细胞癌(Esophageal Squamous Cell Carcinoma, ESCC),是发生于食管,向鳞状上皮分化的恶性肿瘤,占食管癌的绝大多数。预防措施不足和治疗技术不足导致五年生存率低下,迫切需要新的药物用于ESCC的预防或治疗。阿托伐他汀(Atorvastatin)是他汀家族的成员,是甲羟戊酸途径中3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A(HMG-CoA)还原酶的抑制剂,已被用于降低胆固醇水平。越来越多的证据显示,他汀类药物还可以降低癌症的发病率。但是,他汀类药物的抗肿瘤机制尚未完全阐明。近日,郑州大学基础医学院刘康栋教授在国际知名学术期刊Aging在线发表最新研究成果,研究证实了阿托伐他汀可抑制PDX模型中ESCC肿瘤的生长,并进一步运用蛋白质组学和磷酸化组学(景杰生物提供),深入阐释了阿托伐他汀抑制食管鳞状细胞癌细胞增殖的潜在机理。阿托伐他汀可抑制Ras信号通路、cAMP和Rap1信号通路。磷酸化蛋白质组结果表明,阿托伐他汀治疗后ERKT185 / Y187,CDK1T14和BRAC1S1189磷酸化介导的Th17细胞分化,Gap连接和铂类药物耐药途径被下调。1阿托伐他汀抑制ESCC细胞增殖为了评估阿托伐他汀对ESCC生长的影响,研究者用不同浓度的阿托伐他汀处理了KYSE150和KYSE450细胞。结果表明,阿托伐他汀显著减弱了ESCC细胞的生长,而对正常食...
发布时间: 2019 - 11 - 27
翻译后修饰(Post-translational modification, PTM)是指蛋白质在翻译后的化学修饰,越来越多的研究发现,许多重要的生命活动不仅与蛋白质的丰度相关,更重要的是被各类PTM所调控。随着表观遗传学与生物学领域的深入研究,一系列新的酰化类型,如丙酰化、丁酰化、巴豆酰化、琥珀酰化、丙二酰化、戊二酰化、二羟基异丁酰化、三羟基丁酰化、苯甲酰化、乳酸化等被陆续发现,广泛地存在生物体内,与炎症、代谢疾病、肿瘤等疾病密切相关,极大的扩展了人们对代谢调控、信号转导等生命活动的认识。赖氨酸丙酰化(Lysine Propionylation,Kpr)是一种可逆的、广泛分布的翻译后修饰类型,在真核生物和原核生物中均起重要的调控作用。已有研究报道赖氨酸丙酰化在细菌的整体代谢调控网络和代谢酶的活性中起重要作用【1】,并且可能与精子生成与精子功能的发挥密切相关【2】,然而,赖氨酸丙酰化在光合有机体中的程度和功能尚不清楚。近日,中国科学院水生生物研究所的葛峰研究团队在国际专业学术期刊International Journal of Molecular Sciences上发表了丙酰化修饰最新研究成果。研究首次对丙酰化在光合作用生物——蓝藻中的调控功能展开研究,揭示了丙酰化修饰新的生物学功能:参与光合作用和新陈代谢调控,为丙酰化调控的功能范围提供了新的见解。1鉴定Synechoc...
发布时间: 2019 - 11 - 27
蛋白质翻译后修饰(Post-translational modification, PTM)是指蛋白质在翻译后的化学修饰,可调节蛋白质的活性、定位、折叠、以及蛋白与其他生物大分子间(包括蛋白、核酸、脂质等)相互作用。越来越多的研究发现,许多重要的生命活动不仅与蛋白质的丰度相关,更重要的是被各类蛋白质翻译后修饰所调控。近日,来自华中农业大学食品科学技术学院的邱宁课题组,在食品科学领域专业学术期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry连发三篇文章,结合蛋白质组学、磷酸化修饰组学、及N-糖蛋白质组学等方面,系统地阐明了鸡蛋蛋白在胚胎发育过程中的变化,并且首次鉴定了鸭蛋清中的N-糖蛋白,进一步从抗菌性以及致敏性角度提出糖基化差异对不同禽蛋功能的影响。据悉,邱宁课题组孟雅祺、朱方莉、孙浩浩分别为三篇文章的第一作者,景杰生物为该研究的蛋白质组学定量与翻译后修饰组学定量研究提供了技术支持。文章题目:Comparative Quantitative Phosphoproteomic Analysis of the Chicken Egg during Incubation Based on Tandem Mass Tag Labeling内容简介:蛋白质磷酸化作为一种普遍且重要的翻译后修饰,在蛋白质的转运、抗菌、抗氧化等方面具有重要作用。为了...
发布时间: 2019 - 11 - 20
以质谱技术为核心的蛋白组学技术近些年取得了突破性的进展,比如离子淌度分离概念的引入使得蛋白质组学进入了4D新时代。4D蛋白质组学 是在3D分离即 保留时间(retention time) 、 质荷比(m/z) 、 离子强度(intensity) 这三个维度的基础之上增加了第四个维度-- 离子淌度(mobility) 的分离(图1),进而大幅度的提高扫描速度和检测灵敏度,带来蛋白质组学在鉴定深度、检测周期、定量准确性等性能的全面提升。图1. 新一代4D蛋白质组学尽管蛋白质组学技术已经发展的越来越成熟并在生命科学研究的各个领域取得了傲人的成果,但是面对蛋白质组学样本的自身复杂性和目前质谱仪采集速度和灵敏度的局限性,怎样提高样本分析通量、定量稳定性以及数据完整性,特别是在一些大队列样本的系统筛选以及临床应用中,目前仍然是一大挑战。传统的蛋白质组学采用DDA(Data-dependent Acquisition,数据依赖采集)策略,在全扫描质谱图中,肽段信号被选择性碎裂,产生随机(MS/MS)质谱。尽管这种方法非常强大,但它随机选取目标的方式,总是偏向于那些信号最强的峰,因此会引起缺失值(Missing Value)的问题,并且在大规模样本分析中,这种缺陷会被放大。DIA(Data-independent Acquisition,数据非依赖...
发布时间: 2019 - 11 - 19
脓毒症(Sepsis)是指由感染引起的全身炎症反应综合征,是一种微生物感染所引发的宿主反映失调的病症。脓毒症可导致血管功能障碍、器官衰竭甚至死亡,已成为ICU患者死亡的最重要原因之一。多器官衰竭是严重脓毒症的主要特征。然而为什么有些器官会在患者感染后更易发生功能失调甚至衰竭,其分子机制仍然不甚明了。血管是各器官和血液的中间屏障,是研究脓毒症所引起的器官衰竭的重要切入点。不同的血管床可能由于其独特的细胞表面蛋白组和糖组构成,表现出对脓毒症因子的不同相应。糖萼是血管内皮屏障的重要组成部分,是覆盖于血管内皮细胞表面的多糖蛋白复合物的总称。然而,由于缺乏对活体内血管内皮糖萼的分子构成的理解以及有效的检测手段,之前的研究很难去深入观测脓毒症发生过程中血管表面蛋白组的真实反应及重构过程。2019年10月11日,美国California大学的研究人员在著名学术期刊Nature Communications上发表论文,利用体内化学标记和高通量质谱技术对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus , MRSA)脓毒症小鼠模型,进行多器官血管表面蛋白组检测,以揭开血管在全身炎症反应过程中的变化情况。最终作者发现,MRSA脓毒症引起了血管表面蛋白组的显著重构,且具有器官特异性。研究速读一、小鼠器官特异性/非特异性血管蛋白组作者首先采用...
发布时间: 2019 - 11 - 18
阿尔茨海默氏病 ( Alzheimer disease,AD) 是一类精神功能进行性丧失,发病进程缓慢、随着时间不断恶化的神经性疾病 。tau蛋白的淀粉样蛋白 (Aβ) 斑块是AD的主要病理标志 。 Aβ积累发生在AD的早期阶段,并在启动AD发病机理中起关键作用 。但是,大脑中 Aβ 早期沉积到临床症状发作之间存在多年的时间延迟,这必然会 导致诊断延迟。Aβ特异性正电子发射断层扫描 (PET) 配体的开发已成为AD诊断的关键突破。但是由于昂贵的费用、操作时间长以及增加辐射暴露等问题,PET并不是一种理想的方法。 之前的研究已报道过一些与脑淀粉样蛋白沉积有关的基于血液的生物标记物,这些有效的 生物标志物的不同组合可能会提高对脑Aβ沉积的诊断 。基于质谱的蛋白质组学方法能有效处理血浆蛋白组的高度复杂性,已被广泛用于筛选血液生物标记物。在这些基于质谱的蛋白质组学方法中,高度丰富的蛋白质阻碍了低丰度生物标志物候选物的检测。相应的去除高丰度蛋白的方法也有很多。此外,多重标记方法与基于质谱的蛋白质组学分析也已被广泛用于大批患者血浆蛋白组的有效定量。2019年10月9日,国际刊物 Progress In Neurobiology (IF=10.658)上发表韩国首尔国立大学医学院Inhee Mook Jung教授团队的最新文章, 研究通过对认知正常个体,M...
发布时间: 2019 - 11 - 15
种子萌芽是一个复杂的生理过程,从摄取水分开始到胚轴延伸结束,在此过程中,种子的胚细胞会经历从静息代谢到活跃代谢状态的程序性转变。水稻(Oryza sativa)是植物研究中的经典模式生物,针对水稻种子萌芽已经在转录组,代谢组和蛋白组水平上进行了深入研究,但是该过程中的翻译后修饰研究目前还不是很多。泛素化是一种普遍存在的翻译后修饰(PTM),它指的是由泛素激活酶(E1),泛素结合酶(E2)和泛素连接酶(E3)依次催化并最终将泛素(Ub)结合到其底物上来发挥功能。泛素化修饰可以通过调节蛋白的转运、活性和降解等功能来协调植物几乎所有的生长和发育过程。2019年11月2日,湖北大学生命科学学院生物催化与酶工程重点实验室杨平仿教授在Plant Journal上发表题为Quantitative Ubiquitylomics Approach for Characterizing the Dynamic Change and Extensive Modulation of Ubiquitylation in Rice Seed Germination的论文,研究者对水稻种子萌芽过程中的泛素化修饰组以及蛋白组进行研究,找到关键调控通路并进行验证。本篇研究不仅揭示了水稻种子萌芽过程中泛素化以及蛋白组的调控,更扩展了我们对种子萌发过程中这一关键翻译后修饰的理解。景杰生物作为共同署名单位之一,参与了其中...
发布时间: 2019 - 11 - 13
由中华医学会、中华医学会病理学分会主办,河南省医学会、河南省医学会病理学分会承办,郑州大学第一附属医院、国际病理学会(IAP)中国分会、中国医师协会病理科医师分会、中国抗癌协会肿瘤病理专业委员会、中国医疗保健国际交流促进会病理学专业委员会、CSCO肿瘤病理专家委员会、中华病理学杂志、北京精鉴病理学发展基金会协办的中华医学会病理学分会第二十五次学术会议暨第九届中国病理年会将于2019年11月14~17日在河南省郑州国际会展中心举行。会议时间时间:2019年11月14日-17日地点:郑州·郑州国际会展中心景杰展位:B33作为大会重要合作伙伴,景杰生物邀您参与这一行业盛会!本次会议除了以往年会常设的大会主旨报告、各亚专业分会场、读片会、壁报展示交流、专科病理诊断培训,还根据学科发展需要,将开展分子病理前沿论坛,介绍分子病理学领域的最新进展。分子病理学通过化验器官、组织和血液中的分子,对疾病进行研究和诊断。景杰生物作为蛋白质组学技术服务领域的领军企业,提供整体蛋白组学分子病理研究方案,运用基于质谱的蛋白质组学与修饰组学等技术,全面解析样本中蛋白质丰度或翻译后修饰水平。多维度解析疾病发生发展过程的全貌,揭示其分子病理学机制;设计和验证预测性生物标记物,对疾病进行诊断和分类。欢迎各位老师莅临B33展台,垂询业务!景杰生物将以诚挚的服务精神和高质量技术平台,助力各位病理学领域科学家取得...
发布时间: 2019 - 11 - 12
前言And God said, ' Let there be light ', and there was light.---- Genesis 1:346亿年前,地球上一片死寂,毫无生命迹象;20亿年过去了,地球上的情况有了改观,已经出现了一些简单的单细胞生物,但是谈不上有生气。地球太孤寂了,好吧,来点生机吧,于是大气中氧气含量骤升,从5亿年前从1%增加到12%。而正是氧气,生命形态从单细胞过渡到多细胞,地球也就成为了一个独一无二的、生机勃勃的蓝色星球。对人类而言,氧气可能是维持生命最重要的要素,我们可以数日不饮不食,但是不可一刻无氧气。因此在某种程度上说氧是生命之光并不为过。自现代自然科学诞生以来,回顾氧气相关的研究进展,我们会发现这是一部探寻生命奥秘的历史,一段寻找生命之光的历程。适逢70周年国庆,一部《攀登者》的电影引爆影院。我们的登山队员们为了祖国的荣誉,搏命登上地球之巅---珠穆朗玛峰。攀登者持续面临着低氧,寒冷,狂风等常人难以想象的恶劣环境,而缺氧或许是他们面临的最大挑战。在珠峰上空气更加稀薄,单位体积下含氧量只有海平面的25%左右,意味着即使我们静止不动也总觉得喘不上气,何况还要在陡峭的岩壁上向上攀爬。在这种条件下,攀登者步履蹒跚,每前进一步都非常困难。氧气对我们如此重要,因此虽然研究氧气的历史却并不久远,只有两百多年的历史,但是氧气的发现意义重大,直接导致了近代化...
发布时间: 2019 - 11 - 12
蛋白表达水平和信号通路的异常是肿瘤最常见的特征,近些年来的研究表明,相比于仅通过基因组分析,蛋白组和修饰组包含了更多的基因无法识别的新信息,这一观察引出了蛋白基因组学的概念,综合多组学数据的分析能够更全面的认识肿瘤,也为肿瘤未来的精准治疗提供新的思路和方向。2019年10月31日,Cell在线发表了题为: Integrated Proteogenomic Characterization of Clear Cell Renal Cell Carcinoma 的 最新研究成果,来自西奈山伊坎医学院的王培、约翰霍普金斯大学的Hui Zhang和Daniel W. Chan (他们的研究重点是蛋白组学和免疫学技术在诊断、管理以及癌症了解方面的开发及应用)、密歇根大学的Marcin Cieslik和Alexey I. Nesvizhskii 并联合临床蛋白质组肿瘤分析协会 (CPTAC), 运用系统的蛋白基因组学方法深度揭示肾透明细胞癌病理特征 。肾细胞癌 是世界十大常见的癌症之一,其中75%为肾透明细胞癌 (clear cell renal cell carcinoma, ccRCC ) 并占据了肾细胞癌死亡的绝大部分,具有典型的Warburg表型。 为了阐明驱动透明细胞肾细胞癌 (ccRCC) 的功能模块失调,作者对未经处理的...
发布时间: 2019 - 11 - 12
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