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人参皂苷(Ginsenoside)是从五加科植物(人参、西洋参、三七等)中提取和转化出来的一种固醇类化合物,更是天然抗癌活性成分,目前已经被广泛用于癌症辅助治疗。常用的人参皂苷有Rh2、Rg3、Rk2、Rh3、aPPD等。然而能够和靶蛋白互作,发挥抑癌作用的具体人参皂苷成分仍然未知。近几年基于高分辨质谱的蛋白质组学技术已经被成功应用到了多项中药研究中。新技术的发展为更好的解释人参皂苷的抑癌作用机制提供了可能。近日,南开大学药学院白钢教授、侯媛媛副教授团队在著名学术期刊Journal of Proteome Research上发表论文, 利用TMT蛋白质组学定量技术揭示了人参皂苷的抑癌作用机制。研究人员通过对人参皂苷提取物处理的非小细胞肺癌A549细胞系进行定量蛋白质组学和磷酸化修饰组学分析,发现Ras蛋白在多个功能通路中都起到了调节作用,预示着它很有可能是人参皂苷中某一成分的靶蛋白。除此之外,研究人员利用亲和质谱技术筛选出三个Ras结合配体,分别为:20(s)-PPD, 20(s)-Rh2 和20(s)-Rg3。文献精读1、人参皂苷处理引起肺癌细胞内大量蛋白和功能通路变化作者分别用人参皂苷提取物(处理组)和DMSO(对照组)对非小细胞肺癌A549细胞系处理6小时,然后提取全蛋白进行定量蛋白质组学和磷酸化修饰组学(组学策略)。共鉴定到5499个蛋白,以及4820个蛋白上的9135个磷...
发布时间: 2019 - 05 - 27
2019年5月16-19日,“2019中国植物病理学会第十四届青年学术研讨会”于贵州省贵阳市隆重召开,本次会议主题:“青年植病、协同创新、共创未来”。会议促进了我国植物病理学领域研究人员的交流与合作,推动了中国植物病理学学科发展。作为蛋白质组学与翻译后修饰领域的领军企业,景杰生物倾情赞助此次会议,带来了全新的4D蛋白质组学研究解决方案,利用4D-LFQ新技术开启植物病理科研新视野。 此次会议邀请贵州大学校长宋宝安院士、浙江大学马忠华教授、西北农大王晓杰教授、中科院微生物所叶健研究员、中科院植物保护研究所宁约瑟研究员、南京农业大学王源超教授、沈阳农业大学玄元虎教授、华中农业大学朱龙付教授、华中农业大学李博 教授、中国农业大学彭友良教授、中国科学院微生物研究所蔡磊研究员等莅临,共同交流,数百名专家学者齐聚一堂,交流学术知识,碰撞智慧火花,共同推动植物病理学新发展。   近年来随着技术的不断进步,蛋白质组学逐步从方法学研究进入到了实际应用阶段,在植物病理学等研究领域中大放异彩。作为蛋白质组学与翻译后修饰领域的领军企业,景杰生物一直致力于推动蛋白质组学技术与运用的发展,经过长期潜心研发,在蛋白质组学高精度分析方面再次取得突破,率先实现并推出4D-LFQ蛋白质组定量服务,获得了行业内的广泛关注。 会议期间,杭州景杰生物科技有限公司学术经理代剑...
发布时间: 2019 - 05 - 21
景杰学术/报道蛋白质组学为生命科学和医学领域的进步起到了巨大的推动作用,但传统的蛋白质组学技术仍面临着检测通量和定量稳定性等方面的诸多挑战,而这些挑战终于在近期迎来了方法学上的重大突破。2018年12月蛋白质组学领域顶级期刊MCP在线发表了德国马普生化研究所所长、世界著名蛋白质组学专家Matthias Mann教授最新的研究成果。该文章介绍了基于PASEF的timsTOF Pro质谱系统,该质谱采用了专有捕获离子淌度(TIMS)技术,能实现更高速度、更高灵敏度、更强大的4D蛋白质组学分析,展现了其在蛋白质组学领域的强大功能和广泛应用前景。Graphical Abstract蛋白质组学研究对于理解生理条件下生命过程以及病理条件下疾病发生发展都具有非常重要的意义。Bottom-up蛋白质组学实验流程主要包括前期的样品制备、酶解肽段、色谱分离、质谱检测、生信分析。在质谱检测过程中,由于蛋白质组的复杂程度极高,而仪器的扫描速度有限,因此只能选择相对强信号的离子进行检测,但这个过程存在一定的随机性并且会影响后续鉴定的蛋白通量。尽管有研究表明在哺乳动物蛋白组研究上能够实现蛋白组的深度覆盖,但这个过程需要耗费大量的实验投入包括样品制备和检测时间。同时,色谱分离中的共洗脱肽段也进一步加大了分析的难度,也使得许多低丰度蛋白信号被掩盖而无法检出。和基因组以及转录组技术相比,蛋白质组技术由于质...
发布时间: 2019 - 05 - 16
近年来,随着技术的不断进步,蛋白质组逐步从方法学研究进入到了实际应用阶段,并在包括精准医学在内的各个研究领域中大放异彩。然而相比技术上更加成熟的基因组和转录组测序而言,蛋白质组学技术在通量、灵敏度和定量可靠性方面仍然有比较明显的差距,而这些差距的根本原因,还是在于蛋白质组的复杂度极高,而质谱仪的分离和检测能力有限。虽然,人们通过一些体外的标记试剂(如TMT/iTRAQ)和采集分析方式(如DIA)试图在有限的硬件能力上做一些改进,但是仍然不能从根本上来解决问题。        令人欢欣鼓舞的是,这个困扰领域多年的问题在近期取得了重大的突破,这就是以新增的“离子淌度“为特征的4D蛋白质组技术的出现。下面,小编就来带着大家扒一扒什么是“4D蛋白质组”,以及4D蛋白质组能够带来哪些改变。 一. 什么是4D基于质谱的蛋白质组学研究,其基本原理主要是通过对被测样品离子的理化性质的测定来进行分析,根据样品的质量谱图和相关信息能够得到定性定量结果。在3D蛋白质组学中,质谱会根据保留时间(retention time)、质荷比(m/z)、离子强度(intensity)这三个维度的性质对肽段离子进行鉴定和定量。4D蛋白质组学则是在3D分离的基础之上增加了第四维度,离子淌度(mobility)的分离(图1)。离子淌度主要根据离子的形状...
发布时间: 2019 - 05 - 16
随着组学技术的快速发展,通过多组学数据来解析科学问题已成为趋势,这为动植物和人类遗传分析提供了新机遇。作为蛋白质组学以及蛋白质修饰组学领域的领军企业,为推动多组学数据分析新方法发展,景杰生物携手华中农业大学植物科学技术学院,于2019年5月6-9日开展“多组学数据分析新方法研讨会”,满足广大研究生与青年教师处理多组学海量数据的科研需求。 此次会议邀请美国北卡罗来纳州立大学生物信息研究中心曾昭邦教授、加州大学河滨分校徐士忠教授和贾震宇助理教授、华中农业大学严建兵教授、章元明教授、李林教授、杨万能教授、陈伟教授、王茂军教授和鄢文豪教授等莅临,共同交流多组学技术分析在诸多领域的运用与发展,数百名专家学者齐聚一堂,交流学术知识,碰撞智慧火花,共同推动多组学数据分析新方法新发展。 会议期间,杭州景杰生物科技有限公司CEO程仲毅博士,受邀发表学术报告,带来题为“蛋白组到表型组:运用整合蛋白质组学策略解析植物表型”的精彩报告。报告中,程仲毅博士发布了基于全球顶级质谱仪timsTOF Pro的4D Label-free蛋白质组学技术,并首次公开样本分析数据。   景杰生物一直致力于推动蛋白质组学技术与运用的发展,4D Label-free蛋白质组学技术在检测通量、灵敏度、和检测速度等方面革命性的提升,景杰生物将再度引领蛋白组学高精度分析,进一步突破...
发布时间: 2019 - 05 - 14
蛋白质酰化修饰(Acylation)参与多种生物学过程调控,也是近年来备受瞩目的研究热点。从广度上来讲,多种新型酰化修饰被不断发现,且各自在功能和调控机制上有不同的倾向性,展现了这一新兴研究领域的广阔前景;而从深度上来讲,机制的研究愈发精细,从最初的组蛋白调控作用,到如今进展迅速的非组蛋白调控机制,都体现出酰化修饰作为一种广泛存在的修饰类型具有多样的生物学功能。关于乙酰化在非组蛋白中的功能,近年来已有陆续报道,其中很重要的一个层面就是能量代谢的调控。例如在饥饿的条件下,底物浓度乙酰辅酶A的大幅下调和去乙酰化酶SIRT3的高表达,会从两个不同的维度导致整体蛋白质乙酰化修饰水平的下降,并影响一系列代谢酶的功能活性[1-3]。但是有趣的是,这个过程中也会有一些蛋白质出现逆势上调的趋势。那么,这些“另类”的蛋白,究竟是参与何种作用的呢?5月1日,北京大学基础医学院的罗建沅课题组在Molecular Cell发表了题为Acetylation of PHF5A modulates stress response and colorectal carcinogenesis through alternative splicing mediated upregulation of KDM3A的研究报道,揭示了PHF5A蛋白的乙酰化能够通过调节KDM3A介导的选择性剪切,来调控在细胞应激反应,并结肠...
发布时间: 2019 - 05 - 13
已有研究表明茶树是一种喜铵作物,但有关茶树响应铵态氮的巴豆酰化修饰机制至今未见报道。赖氨酸巴豆酰化修饰(Crotonylation)参与转录调控并能够改变蛋白质的理化性质,其在细胞过程中发挥着重要作用。青岛农业大学丁兆堂教授团队以一年生的青农3号茶树品种为材料,对茶树铵态氮缺乏/复供条件下非组蛋白巴豆酰化修饰的响应机制进行了探讨。Western Blotting分析表明茶树叶片中的蛋白质普遍存在巴豆酰化修饰,而且巴豆酰化修饰水平在铵复供3小时和3天时具有明显变化,这表明在铵复供后茶树叶片中蛋白质发生了明显的赖氨酸巴豆酰化修饰。该研究发现,在铵复供条件下,茶树叶片中的971种蛋白质上存在2288个赖氨酸巴豆酰化修饰位点。其中,大多数巴豆酰化修饰蛋白位于叶绿体和细胞质中。与铵缺乏相比,在铵复供3小时和3天分别有120和151个巴豆酰化修饰蛋白差异表达。这些修饰蛋白主要参与茶树初级代谢过程,如光合作用(PsbO、PsbP、Pbs27,PsaN、PsaF和FNR),碳固定(rbcs、TK、ALDO、PGK和PRK)和氨基酸代谢(SGAT,GGAT2,SHMT4和 GDC)。通过对差异表达巴豆酰化修饰蛋白进行分析,发现这些蛋白质主要富集在巴豆酰化修饰介导的光合作用、碳固定和氨基酸代谢通路中,并形成密切的相互作用网络。值得关注的是,大量发生了巴豆酰化修饰的酶,如Rubisco、TK、...
发布时间: 2019 - 05 - 13
为加强旱区作物逆境生物学国家重点实验室建设,展现最新科研成果,激发研究生科研热情,5月12日,由景杰生物赞助的旱区逆境生物学国家重点实验室第六届研究生论坛与景杰奖学金评选活动,在西北农林科技大学盛大开幕,100多名师生代表参加此次论坛,中国工程院院士、重点实验室主任康振生等作为论坛嘉宾受邀参加论坛。  康振生院士介绍了旱区作物逆境生物学重点实验室取得的成绩,并从科学研究,人才培养和服务社会的层面强调培养高素质人才的重要性,希望广大科研人员能够充分培养创新意识和科研能力,通过不懈奋斗,获得具有创新性、突破性的科研进展。也希望本次论坛能够进一步促进和推动旱区作物逆境生物学“双一流”学科群建设,为我国旱区农业生产提供更丰富的理论指导与技术支撑。 “景杰奖学金”由杭州景杰生物科技有限公司出资设立,用于奖励旱区作物逆境生物学重点实验室全日制研究生,持续推动旱区作物逆境生物学发展,激发科研热情。经过稿件初选、选手答辩、专家评审等环节,最终园艺学院周坤获得一等奖,植保学院王宁、边瑞玲、许铭、齐朝妹,生命学院李远凤获二等奖,张玉民、胡洋、李卫卫等同学获三等奖。   景杰生物王云龙经理代表景杰生物与西北农林科技大学园艺学院王跃进教授为一等奖获得者颁奖并作简短发言。  “站在巨人的肩膀上,能看得更远。”第一名获奖者周坤表示...
发布时间: 2019 - 05 - 12
磷酸化是一种非常重要的翻译后修饰,在多种生命活动的调控包括生物的生长发育、信号转导以及疾病进程等过程中发挥不可或缺的功能。当下蛋白质组学研究正如火如荼地发展,随着技术的不断成熟,依赖于质谱的蛋白质磷酸化的检测,极大地推动了磷酸化蛋白质组学的发展。目前景杰生物的高通量磷酸化体系进行了全面升级,体现在:1.技术升级:项目平均通量超过10000个位点。2.质控升级:FDR和FLR双重质控,挤掉1/4的“水分”。3.生信分析升级:激酶预测、信号通路分析,深度挖掘数据。5.13-6.30日,高通量磷酸化修饰组还有买五送一的优惠活动,详情可联系当地客户经理。产品介绍:景杰生物高通量磷酸化修饰组学。
发布时间: 2019 - 05 - 11
景杰学术/精选大家好,PTM BIO作为蛋白质修饰类抗体的开拓者,开发出大量高质量独一无二的蛋白质修饰泛抗体以及组蛋白修饰抗体。经过多年耕耘,PTM BIO在业内积累了良好的口碑,大量PTM BIO抗体应用文献见诸报道。今天小编摘取2019年第一季度发表的代表性PTM BIO蛋白质修饰抗体应用文献,以飨读者。01Nature Communications:丙二酰化调节GAPDH与mRNA之间的结合促进炎症关键信号相关产品:丙二酰化泛抗体PTM-901,丙二酰化泛抗体偶联树脂PTM-904应用:Western Blot,Immunoaffinity Chromatography.来自都柏林圣三一学院和GSK的研究人员合作,首次关注了巨噬细胞-炎症反应-代谢-丙二酰化修饰之间的密切关系。研究人员通过对小鼠骨髓来源的巨噬细胞进行脂多糖(LPS)处理。在LPS处理下,巨噬细胞中丙二酰辅酶A含量显著上升,并激活细胞内蛋白乙酰化修饰。研究者进行丙二酰化修饰组学分析(修饰组学应用丙二酰化修饰泛抗体树脂,相关产品),共鉴定到412个蛋白上的843个发生了丙二酰化修饰的位点。 02Cell Death & Disease:P53 β-羟基丁酰化修饰减弱其肿瘤抑制功能相关产品:β-羟基...
发布时间: 2019 - 04 - 25
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