市场与支持 News
为了共同探讨蛋白质组以及翻译后修饰组学的最新进展,推动其在生物医学等领域的转化应用,2019年6月30日,“中山看“景”:蛋白质修饰前沿论坛”在复旦大学附属中山医院圆满落幕。作为蛋白质组学以及蛋白质修饰组学领域的领军企业,杭州景杰生物科技有限公司有幸受邀与中山医院临床医学研究院联合举办此次会议。 此次论坛大咖云集,复旦大学生物医学研究院余红秀教授,上海交通大学基础医学院院长程金科教授,同济大学田志新教授,上海市中医肿瘤研究所所长贾立军教授,上海交通大学医学院附属仁济医院许杰教授,上海交通大学医学院附属瑞金医院王晓教授,上海交通大学医学院李斌教授,华东师范大学李晓涛教授,海军军医大学免疫学研究所陈涛涌教授,景杰生物高级质谱专家卜晨博士,景杰生物高级应用专家张曜辰博士等学者出席了本次论坛,并带来精彩报告。 复旦大学生物医学研究院余红秀教授带来《Sirt5在炎症和肿瘤中的功能与机制》的报告。报告指出巨噬细胞在被LPS激活后会大量消耗葡萄糖,糖酵解作用显著增强,表达M1型分子标志物并大量产生炎性因子IL-1β,其机制是糖代谢中间产物琥珀酸(Succinate)累积,琥珀酸稳定的Hif-1α加强了IL-1β的转录,揭示出修饰与免疫的重要关联。 上海交通大学基础医学院院长程金科教授带来《线粒体蛋白的SUMO修饰与代谢》的报告。报告指出SUMO化修饰能够修饰线粒体S...
发布时间: 2019 - 07 - 04
6月17日-20日,第30届国际拟南芥大会(ICAR2019)在湖北武汉盛大召开。来自全球40个国家和地区的参会代表共1000余人参加大会。这是国际拟南芥大会第二次来到中国举办。本届大会由华中农业大学承办,中国科学院遗传与发育研究所、湖北省遗传学会、武汉大学、作物遗传改良国家重点实验室、杂交水稻国家重点实验室协办。中国科学院院士张启发教授、王学路教授和杨维才研究员担任大会主席。华中农业大学校长李召虎教授和中国科学院院士许智宏教授在开幕式上致辞。 国际拟南芥大会被公认为是全球植物科学领域水平最高的学术会议。本次会议大会共设计有208场学术报告,邀请了包括美国科学院院士Elliot Meyerowitz、董欣年、陈雪梅、邓兴旺、何胜阳、朱健康教授,中国科学院院士许智宏、李家洋和曹晓风教授等一批在全球具有卓越声望的科学家作报告。大会报告共分为7个专题,还有20个分会报告,主要议题有植物发育调控机制、植物抗病机制、植物抗逆机制、植物基因组学、植物能源与代谢、植物信号转导、从模式植物到作物研究等。 作为本次大会的特邀支持单位和蛋白质组学、翻译后修饰组学技术服务的领跑企业,景杰生物积极参与大会的推介与产品推广。本次会议中,携植物抗逆、分子育种、深度覆盖磷酸化等行业领先的蛋白质组学与翻译后修饰组学解决方案参会,与参会代表密切沟通交流。同时,会中介绍的新一代4D-LFQ蛋白质组...
发布时间: 2019 - 06 - 28
为了共同探讨蛋白质组学技术在衰老领域的最新进展,推动蛋白质组学在衰老研究方面的转化应用,由南昌大学生命科学学院衰老所和景杰生物合办的“衰老及相关疾病的组学研究研讨会“于2019年6月22日在南昌大学如期举行。研讨会吸引了众多的参会人员,会议现场气氛热烈,引起了广泛关注。  研讨会现场在会议正式开始之前,南昌大学生命科学学院院长田小利教授对各位嘉宾做了简要介绍,并对各位嘉宾的到来表示了热烈的欢迎。 南昌大学生命科学学院院长 田小利教授上海交通大学医学院附属第九人民医院雷鸣教授带来了《肿瘤抗原SAGE1促进转录失调的机制研究》的精彩报告。运用MS/MS技术及co-IP等技术方法,雷教授研究了正常细胞中不表达的肿瘤睾丸抗原SAGE1,一旦在肿瘤细胞中表达会直接与Integrator复合物中的INTS3蛋白质相互作用,竞争破坏INTS3-INTS6的结合并形成新的INTS3-SAGE1复合物,为癌症治疗提供新的思路和靶点,并为未来进一步揭示肿瘤睾丸抗原与肿瘤发生的调控机理打下基础。 上海交通大学医学院附属第九人民医院 雷鸣教授杭州景杰生物科技有限公司CEO程仲毅博士带来了《From Proteome to Phenome: Phenome Decoding by Integrated Quantitative Proteomics Appr...
发布时间: 2019 - 06 - 28
糖尿病(Diabetes Mellitus,DM)是一种以长期高血糖为主要指标的代谢紊乱综合症,伴随着多种并发症及合并症,其中以2型糖尿病的发病率最高。越来越多的证据显示,胰腺β细胞功能的下降是2型糖尿病发病机制的核心。然而我们目前对于引起胰腺β细胞功能紊乱的分子机制层面信息还知之甚少。磷酸化是调节胰岛素分泌的一个重要参与因子,尽管近年来随着多组学技术的发展和普及,利用基因组、转录组或者基于高分辨质谱的蛋白质组学来研究2型糖尿病的案例已层出不穷,但是磷酸化修饰在因胰腺β细胞功能紊乱而伴随的关键信号通路转变中的机制尚不清楚。因此,从磷酸化修饰组学的角度揭示调控胰岛素分泌的分子机制具有十分重要的研究价值。2019年6月4日,来自德国马普生物化学研究所的Matthias Mann团队在国际著名期刊Cell Metabolism上发表文章,利用磷酸化修饰组学探寻影响胰岛素分泌的分子信号通路,为之后2型糖尿病的药物靶点研发和治疗提供了坚实的科学依据。作者采用Label-free的技术对正常小鼠和肥胖糖尿病小鼠的胰岛组织进行了蛋白质组和磷酸化修饰组学的分析,一共鉴定到6500个蛋白以及13000个磷酸化肽段。研究发现GSK3-PDX1轴是控制胰岛素分泌的关键信号节点,抑制GSK3能恢复胰腺β细胞面对高糖处理时正常分泌胰岛素的能力。研究精读1、糖尿病小鼠胰岛组织内蛋白和磷酸化整体水平发生显著变化...
发布时间: 2019 - 06 - 24
近日,New Phytologist( IF=7.299 )在线发表了浙江大学园艺系卢钢教授团队和澳大利亚Newcastle大学环境和生命科学学院阮勇凌教授团队合作的最新研究成果Evidence for a specific and critical role of mitogen-activated protein kinase 20 in uni-to-binucleate transition of microgametogenesis in tomato。该研究发现SIMPK20在花粉发育单核到双核的的转化过程发挥重要功能,其中蛋白质组学技术为揭示具体的调控机制提供分析基础。丝裂原活化的蛋白激酶(MAPKs)调节植物生长的各个环节,然而其在植物生殖发育过程中的潜在功能现在知道的还不是很清楚。本篇文章针对SIMPK20这种植物特异性的D型MAPK展开研究。研究者首先运用CRISPR/Cas9或RNAi技术敲除或敲低SIMPK20,研究结果表明花粉的生存能力受到显著抑制。进一步转录组和蛋白组分析发现SIMPK20敲除后显著减少番茄中控制糖和生长素代谢的蛋白表达并且扰乱了花粉发育过程中单核到双核的转化。野生型 (WT) 和 CR-9 型番茄雄蕊中DEGs的表达分析最后研究者通过蛋白-蛋白互作分析证明SIMPK20可能通过调控下游蛋白SIMYB32来促...
发布时间: 2019 - 06 - 24
2019年6月,国际专业学术期刊 Science of the Total Environment(IF =4.610)在线发表了山东农业大学王金信教授团队题为Unravelling mesosulfuron-methyl phytotoxicity and metabolism-based herbicide resistance in Alopecurus aequalis: Insight into regulatory mechanisms using proteomics的最新研究成果。文章通过蛋白质组学+靶向蛋白质组学PRM验证等方法,揭示了作物生产中杂草植物对除草剂耐药性的机制,为农业领域提高作物产量提供一定的指导意义。 杂草植物对全世界的作物生产带来了严重的威胁,其进化出的非靶向位点依赖的抗性(NTSR)是一种研究较少的多基因特征,使得杂草植物对于除草剂具有非常强的抗性。已有的研究表明细胞色素P450s能提高甲基二磺隆(Mesosulfuron-methyl)这种高效除草剂的代谢速率进而可能在NTSR 中发挥作用,但更深入的机制现在知道的并不多。山东农业大学王金信教授团队运用iTRAQ蛋白质组学定量技术针对没有抗性和有抗性的看麦娘这种杂草进行研究,差异蛋白分析结果表明除草剂会造成杂草植物在光合作用、氧化还原平衡等过程的损伤。相比之下,抗...
发布时间: 2019 - 06 - 21
近年来,随着技术的不断进步,蛋白质组逐步从方法学研究进入到了实际应用阶段,并在包括精准医学在内的各个研究领域中大放异彩。然而相比技术上更加成熟的基因组和转录组测序而言,蛋白质组学技术在通量、灵敏度和定量可靠性方面仍然有比较明显的差距,而这些差距的根本原因,还是在于蛋白质组的复杂度极高,而质谱仪的分离和检测能力有限。虽然,人们通过一些体外的标记试剂(如TMT/iTRAQ)和采集分析方式(如DIA)试图在有限的硬件能力上做一些改进,但是仍然不能从根本上来解决问题。令人欢欣鼓舞的是,这个困扰领域多年的问题在近期取得了重大的突破,这就是以新增的“离子淌度(ion mobility)“为特征的4D蛋白质组技术的出现。和常规的3D蛋白组相比,新一代的4D蛋白组学充分利用了第四维ion mobility的信息,实现了更加specific的匹配,在扩大检测深度的同时提高了准确性,独特的性能使其成为蛋白组学复杂样本深入研究的利器,使得许多其他科学问题与临床运用的探索成为可能。在日前召开的美国ASMS大会上,添加了离子淌度的4D蛋白质组学技术成为了焦点:Thermo公布添加离子淌度的新一代质谱仪登场,Bruker联合Matthias Mann、Ruedi Aebersold和Juergen Cox教授等公布了4D-LFQ的两类解决方案——diaPASEF和MBR-ddaPASEF,...
发布时间: 2019 - 06 - 14
在美国ASMS大会上,添加了ion mobility维度的4D蛋白质组学技术成为了焦点。继2018年底,Matthias Mann从硬件革新的角度阐释了其巨大的潜力之后[1],今年5月27日同样来自马普研究所的Jurgen Cox组发表了关于4D label-free的shotgun定量方法,通过四维对齐的方式显著减少了missing value,并提高了定量的准确性[2]。仅仅几天之后的5月31日,Matthias Mann和Reudi Aebersold组又联合在bioRxiv上发布了新的数据非依赖采集的4D lable-free定量方式——diaPASEF[3],并在随后的ASMS大会上进行了展示(图1)。 图1 在ASMS大会上关于4D label-free的diaPASEF方法的报告Shotgun(也被称为DDA)是目前广泛使用的蛋白质组学方法,随着软硬件技术的发展,其在检测深度、通量和定量准确性方面都取得了巨大的进步,并在临床样本的分析中取得了诸多应用。然而, DDA方法因为其采集的随机性导致了其在定量重复性上的巨大挑战。相反,采用分段式采集的DIA的思路则解决了随机性的问题,并在重复性上有着出色的表现。然而传统DIA也有其本身的困境:其分段式采集导致了谱图的复杂性极高,给后续的分析带来巨大困难。缩窄采集窗口可以降低这种...
发布时间: 2019 - 06 - 14
近日,蛋白质组学Top期刊Mol Cell Proteomics发表了福建农林大学林向民教授团队琥珀酰化修饰组学的文章,研究揭示赖氨酸琥珀酰化修饰在著名的鱼类病原体——嗜水气单胞菌的生理调控机制。蛋白琥珀酰化修饰组学分析结果表明,琥珀酰化修饰参与多种代谢途径和生物过程,包括翻译、蛋白运输和中心代谢途径等,在s -核糖同型半胱氨酸裂解酶 (LuxS) 赖氨酸的K23和K30位点琥珀酰化正调控群体感应自诱导因子AI-2的产生,最终改变其与另一病原体溶藻弧菌的竞争力。文章通过对嗜水气单胞菌琥珀酰化修饰组学的分析,更全面地了解琥珀酰化修饰变化蛋白对重要生理功能,将有助于预防和治疗这一重要病原体。文章的第一作者是姚祖杰博士,景杰生物为该研究的蛋白质琥珀酰化修饰质谱检测提供了技术支持。 众所周知,大多数蛋白质的翻译后修饰(PTMs)是动态的、可逆的,对调节各种生物体的细胞生理和病理至关重要。在不同种类的细菌中发现了许多不同的PTMs,包括磷酸化、糖基化、亚硝基化和酰化。其中赖氨酸酰化修饰是细菌中最重要的PTMs之一。与真核生物蛋白一样,细菌赖氨酸琥珀酰化(Ksucc)在进化上是保守的,并参与核心代谢途径,包括三羧酸(TCA)循环、糖酵解和丙酮酸代谢。因此,对生物体内Ksucc的全面鉴定对于理解不同生理条件下的基本生物活动和反应机制至关重要。虽然PTM谱已被鉴定为某些细菌种类...
发布时间: 2019 - 06 - 10
多潜能性(pluripotency)是指高等植物细胞,在伴随胚胎发育的同时逐渐丧失了发育成个体的能力,仅具有分化成有限细胞类型以及构建组织的潜能的特性。比如我们熟知的干细胞就是一种具有多潜能性的细胞。近日,美国国立卫生研究院的研究人员在国际专业学术期刊Cell Systems上发表了一篇采用多组学的分析方法揭示多潜能分期进展的动力学的文章。多潜能干细胞是高度动态和持续发展的,多潜能性的原始态(naive)和始发态(primed)这两种状态在之前已经被深入研究过,但是对两者的中间状态和转换过程知之甚少。在本研究中,研究人员通过研究从原始态到始发态的多潜能性的胚胎干细胞的蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学,转录组学和表观基因组学,综合性地分析了胚胎着床前到着床后胚层分化的多能态转变动力学,结果发现磷酸化蛋白质组学具有快速、急性和广泛变化的特点,且优先于其他三类组学的有序变化。通过本研究,研究人员对潜能性阶段进展的多层控制提出了新的见解,并为调控潜能性状态转变的模型机制奠定了基础。文献精读1. 胚胎干细胞多能性的多组学图谱为了揭示蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学,转录组学和表观基因组学在从原始态(naive)到始发态(primed)多能性转变过程中的时间动力学,有研究人员使用了一个先前验证过的系统来诱导小鼠原胚胎干细胞(ESCs) 植入上胚层样细胞(EpiLCs)。在由ESC到EpiLC...
发布时间: 2019 - 06 - 10
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