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肥胖可导致2型糖尿病,心血管和肝脏疾病等一系列疾病,甚至影响女性怀孕与生育,是当代医学面临的一个严重的公共卫生问题。不同个体发生肥胖的原因也高度各异,个体遗传学的差异有助于,但还不能充分解释这种异质性发生的原因。更好地认识导致肥胖倾向的非遗传因素可能有助于识别个体发展为肥胖的风险,改善本病状态。目前,科学研究发现人体内肠道微生物群与肥胖有关,其中微生物群组成影响代谢信号的一个途径是通过脂多糖(LPS)诱发炎症反应,肠道微生物代谢产生的LPS,通过TLR4激活产生包括肿瘤坏死因子 (TNF-α)和白细胞介素- 6 (IL - 6) 在内的炎症分子,这些因子会干扰瘦素和胰岛素信号传导途径。除此之外,微生物群的组成也会影响食物能量的吸收。2019年7月1日,来自乔治亚州立大学和加州大学的Andrew Gewirtz和David J. Gonzalez团队合作在蛋白质组学Top期刊MCP上发表题为Associations of the fecal microbial proteome composition and proneness to dietinduced obesity文章。研究人员运用宏蛋白质组学等技术对肠道微生物群展开研究,研究揭示了肠道微生物群与饮食诱发肥胖的关系,发现粪便微生物宏蛋白组可作为预测饮食诱导的肥胖的微生物生物标志物。&#...
发布时间: 2019 - 10 - 16
在直肠癌和胰腺导管腺癌中,最常见的KRAS基因突变使原本处于氨基酸序列中第12位的甘氨酸突变成天冬氨酸(KRASG12D)导致KRAS蛋白处于始终激活状态,并最终导致患者生存期变短和不良预后的后果。因此,KRAS蛋白是一个具有高价值的药物作用靶点,然而目前把它作为一个可直接针对的药物靶点还未取得巨大突破。近日,麻省理工大学的研究人员在著名学术期刊Cell Systems上发表论文,利用蛋白组和磷酸化修饰组学系统研究由KRAS基因突变所引发直肠癌和胰腺癌中信号通路的变化。结果发现了数个参与了KRAS蛋白调节信号通路的非经典致瘤调节因子并且通过统计人性化分析(statistical humanization)结合小鼠和人类的蛋白磷酸化组学数据揭露了跨种属(cross-species)的治疗方向。作者首先通过TMT定量蛋白质组和磷酸化组(质谱策略)对KrasG12D和KrasWT结肠上皮组织,结肠癌组织,胰腺组织和胰腺癌组织(样本策略)进行了鉴定和比较。在这四个不同的组织中,KrasG12D导致了93个蛋白和43个磷酸化位点发生了显著的差异表达。作者通过运用PPIN(protein-protein interaction network)绘制了一幅以KRAS为核心的网络图。通过这幅网络图,作者不仅发现一些已知的KRAS 调节因子和效应因子,还发现了一些新的可被KRAS...
发布时间: 2019 - 10 - 15
编辑注 | 我们一直致力于打造蛋白质组学领域最自由的学术交流平台,专家视界是我们的一次尝试。我们会不定期邀请领域内的专家与学者,或分享他们的见解、体验和对未来的展望,内容涉及科研、临床、运用等蛋白质组学各个方向,欢迎关注!马克斯·普朗克生物化学研究所(Max Planck Institute of Biochemistry)的Jürgen Cox教授领导的计算系统生物化学小组开发了用于鉴定和定量细胞、动物组织和体液分子成分的计算方法。该研究小组致力于利用来自基于质谱技术(MS)的蛋白质组学研究和高通量测序技术(NGS)所产生的大数据,通过计算统计分析和计算机建模,来实现识别生物分子的相互作用并破译其生理功能。 ▲  Professor Jürgen Cox通过和Matthias Mann教授领导的研究部门合作,Cox团队开发出了MaxQuant软件——一种用于蛋白质组学定量分析软件工具,可用于分析MS所产生的数据。凭借着严谨而强大的功能,以及对众多平台的广泛支持性,MaxQuant业已成为蛋白质组学研究中最常用的搜库软件平台之一。其集成的MaxLFQ定量模块和match between runs功能,使得其在label-free定量方面的表现尤其突出。此外,Cox团队的研究还集中在医学上,他所开发的方法可在其他广...
发布时间: 2019 - 10 - 15
景杰学术/报道肿瘤的免疫治疗作为一种创新的治疗方式,显著提高了患者的生存率,已成为肿瘤治疗研究领域的一大热点。2018年诺贝尔生理学或医学奖授予了美国免疫学家詹姆斯·艾利森(James Allison)和日本免疫学家本庶佑(Tasuku Honjo),以表彰他们在癌症免疫疗法的贡献。 ▲ 2018 年诺贝尔医学及生理学奖获奖者:James Allison(左)、本庶佑(右)免疫检查点抑制剂(ICIs)目前被认为是黑色素瘤免疫治疗的主流,特别是针对细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白4 (CTLA-4)或程序性死亡1 (PD1)免疫检查点的抗体,然而大约50%的患者对治疗没有反应。与广泛的转录组学研究相比,黑色素瘤的深入蛋白质组学分析尚未很好的开展。9月19日,国际顶级学术期刊Cell在线发表了题为“Proteomics of Melanoma Response to Immunotherapy Reveals Mitochondrial Dependence”的文章。研究人员通过对接受肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)或抗程序性死亡(PD1)免疫治疗的晚期黑色素瘤患者的蛋白质组学研究,表明了黑色素瘤的代谢状态与免疫治疗反应之间的关系。研究运用蛋白质组学定量技术,召集了两组使用TIL或抗PD1治疗的患者进行研究。对116名患者的分析显示,两种治疗方案的...
发布时间: 2019 - 10 - 15
肝癌在全球范围内癌症死因占据第四并呈现逐年递增的趋势,对人们的健康造成严重的威胁。肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma, HCC)占肝癌总数的85%-90%,而慢性乙肝病毒(hepatitis B virus,HBV)感染是导致我国肝癌发生的最主要原因,约85%的肝细胞癌患者携带HBV感染标志。尽管已有针对肝癌的基因组相关研究工作,但并非所有癌症的DNA水平变异都具有明确的生物学意义,这些快速增长的组学数据并没有带来新的生物标记物和临床药物靶标的发现。在今年初贺福初院士团队与樊嘉院士团队在Nature发表运用蛋白组学方法发现早期肝癌新药物靶点的研究(查看详细解读:喜见花开凤凰飞,中国人类蛋白质组计划发现肝癌精准治疗新靶点)扩展了人们对于肝癌领域研究的认识,但肝癌的发生发展是一个复杂的过程,受到多种内外环境因素的调控,尤其对于感染HBV的肝癌,系统性的相关研究目前报道还很少。蛋白表达水平和信号通路的异常是肿瘤最常见的特征,然而针对肝癌的蛋白组和磷酸化修饰组学研究现在还很少。近些年来的研究表明,相比于仅通过基因组分析,蛋白组和修饰组包含了更多的基因无法识别的新信息,这一观察引出了蛋白基因组学的概念,综合多组学数据的分析能够更全面的认识肿瘤,也为肿瘤未来的精准治疗提供新的思路和方向。2019年10月3日,复旦大学附属中山医院樊嘉院士、中国科学院上海药物研究所周虎研究...
发布时间: 2019 - 10 - 15
报道/景杰学术2019年9月19日-22日,第二十二届全国临床肿瘤学大会暨2019年中国临床肿瘤学会(CSCO)学术年会在厦门国际会议中心盛大起航!本次会议以“创新精准研究,探索智慧医疗”为主题,国内外近3万名临床肿瘤学领域的专家学者齐聚厦门,共襄盛举。景杰生物作为肿瘤蛋白质组学领域领军企业,再次亮相大会,携手肿瘤医学领域诸多大咖共话“精准研究”。蛋白质组学作为肿瘤精准医疗的核心,也是近年来CSCO会议上的热门讨论话题。本次大会首个报告,为中国人民解放军军事科学院贺福初院士带来题为《蛋白质组学驱动的精准医学》的大会报告。贺院士指出,肿瘤存在异质性,通过蛋白质组学研究能够发现新的预后标志物及治疗靶标,助力精准医学未来发展。他以肝癌为例,介绍了如何通过蛋白组学判断肝癌的不同阶段、类型及预后,实现良恶性的区分。他指出,基础医学的发展是肿瘤防治事业进步的奠基石,蛋白组学基础与转化研究在肿瘤的诊断、分型及预后中存在重要价值,SOAT1有望在多癌肿中成为预后标志物及治疗靶点,成为未来研究重点和发展方向。▲ 贺福初院士带来题为蛋白质组学驱动的精准医学的首场大会报告蛋白质组学的发展,为肿瘤的机理研究、分子分型、临床诊断带来了新的变革。作为肿瘤蛋白质组学科研服务领域的领军企业,此次会议期间,景杰生物带来的“全新一代,4D肿瘤蛋白质组学技术”专题报告,吸引了与会学者的热烈关注和垂询。新一代4D蛋白质组...
发布时间: 2019 - 09 - 24
编辑注 | 我们一直致力于打造蛋白质组学领域最自由的学术交流平台,除专家视界栏目,通过不定期邀请领域内的专家与学者,或分享他们的见解和对未来的展望外,还将定期精选与蛋白质组学、翻译后修饰等相关科学研究盘点,内容涵盖精准医学、表观遗传学与组蛋白修饰、外泌体、植物蛋白质组学等方面。欢迎关注!2019年9月21日,是第26个“世界阿尔兹海默病日”。阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease,AD)是一种以进行性记忆力减退、认知功能下降和人格改变为主要临床表现的中枢神经系统退行性疾病。今年“世界阿尔兹海默病日”的主题是“从容面对,不再回避”,实际上“从容面对”阿尔兹海默症并不容易。尽管2018年世界卫生组织已将阿尔兹海默与其他失智症列入全球前五大致死原因,但人类始终对阿尔兹海默症束手无策。与此同时,阿尔兹海默病还是老龄人口中发病率最高的疾病之一,据了解,2018年全球共有5000万余人患有阿尔兹海默病,平均每3秒,就会新增一位患者。面对这一世界级难题,全球许多的科学家都投身于阿尔兹海默症的病理和治疗研究,以希望最终能够攻克这一可怕的疾病。蛋白质组学是中心法则的中间位置,也是精准医学研究的核心内容,为阿尔兹海默症的研究提供了更精确、更可靠的信息。蛋白质组学在AD研究最常见的两种模式:一是通过蛋白质组学、修饰组学寻找新型标志物。其中脑脊液检测被称为“金标准”,但取样困难,而...
发布时间: 2019 - 09 - 24
景杰学术/解读乙酰辅酶A是能源物质代谢的重要中间代谢产物,在体内能源物质代谢中是一个枢纽性的物质。糖、脂肪、蛋白质三大营养物质通过乙酰辅酶A汇聚成一条共同的代谢通路——三羧酸循环和氧化磷酸化,经过这条通路彻底氧化生成二氧化碳和水,释放能量用于ATP的合成。乙酰辅酶A作为乙酰基供体用于Nε-赖氨酸乙酰化,实现蛋白质乙酰化。最新研究发现,内质网乙酰化功能失调跟发育以及退行性疾病密切相关。AT-1/SLC33A1是内质网乙酰化机制的关键蛋白,它将乙酰辅酶A从细胞质转运到ER腔中。AT-1/SLC33A1基因在自闭症患者和智力残疾的患者中过表达。AT-1/SLC33A1中的杂合突变与家族性痉挛性截瘫相关,而纯合突变与发育迟缓和过早死亡有关。2019年9月2日,Nature Communications发表了威斯康星大学麦迪逊分校医学系Luigi Puglielli教授团队的最新研究成果,研究者运用蛋白质组学、乙酰化修饰组学技术研究了失调的AT-1活性对细胞内乙酰辅酶A稳态的影响。研究发现,由低活性或过分活跃的AT-1引起的细胞内乙酰辅酶A通量的变化会对表型产生重要影响。AT-1是细胞内通讯网络的重要组成部分,可促进不同细胞区室和细胞器之间的功能性交流,从而维持乙酰辅酶A稳态。 为了研究AT-1活性对细胞内乙酰辅酶A稳态的影响,研究者首先建立了两种AT-1失调的模型:AT-1单倍体...
发布时间: 2019 - 09 - 23
景杰学术/精选编辑注 | 我们一直致力于打造蛋白质组学领域最自由的学术交流平台,除专家视界栏目,通过不定期邀请领域内的专家与学者,或分享他们的见解和对未来的展望外,还将定期精选与蛋白质组学、翻译后修饰等相关科学研究盘点,内容涵盖精准医学、表观遗传学与组蛋白修饰、外泌体、植物蛋白质组学等方面。欢迎关注!生殖是物种繁衍的永恒主题,是动物及人类繁衍的必经过程,同时也是保证生物多样性的基础。生殖生物学(Reproductive biology)是研究整个生殖过程的一门学科,主要研究性别决定、性腺发育、配子发生、受精、胚胎发育及着床、妊娠维持、胎盘发育和分娩等过程的调控,以及生殖道的恶性肿瘤、异常妊娠、生殖道感染、环境和职业性危害等对生殖的影响等问题。此外,生殖生物学也研究在青春期、泌乳期、衰老期和妊娠期等过程中与生殖相关的内分泌变化等,已成为生物学中一个活跃的、充满机遇和挑战的重要研究领域。蛋白质组学,尤其是蛋白质的翻译后修饰是近年来的研究热点,对揭示生殖发育调控的分子机制具有重要价值。近年来,随着蛋白质组学技术的快速发展,已经广泛应用到生殖生物学的研究过程中,使得人们对生殖过程中的各种现象及其分子机制的了解有了长足的进步。为促进我国生殖生物学领域同行的交流与合作,由中国动物学会生殖生物学分会和中国生理学会生殖科学专业委员会联合主办的第三次联合学术年会暨生殖生物学分会第十七次学术...
发布时间: 2019 - 09 - 18
精神分裂症是一种重性精神疾病,其特点是存在一系列症状,包括阳性症状(幻觉、妄想、异常集中和运动障碍)、阴性症状(冷漠、缺乏快感、贪婪和扁平化),以及认知症状(管理功能和注意力方面的缺陷)。虽然精神分裂症的主要病因尚未被确认,但有大量证据表明基因DNA序列的变异、表观遗传修饰改变以及蛋白表达水平差异在精神分裂症的发病机制中起着重要作用。近日,来自芬兰东方大学维尔塔宁分子科学研究所以及赫尔辛基大学神经科学中心的Šárka Lehtonen 教授、Jari Koistinaho教授团队将相关研究成果共同发表在了Nature Communications上。研究者使用诱导多能干细胞衍生的神经元进行建模,并且使用诱导自精神分裂症的单卵双胞胎多能干细胞衍生的神经元,从而最小化遗传异质性,增强疾病特异性信号。蛋白质组学分析结果揭示了精神分裂症更多地与糖胺聚糖、GABA能突触、唾液酸化和嘌呤代谢途径的改变相关。cAMP和WNT信号通路、神经元分化和突触功能也可能在家族性精神分裂症和携带渗透性遗传变异的患者中发生改变。研究同时发现了精神分裂症的性别特异性:尽管在健康的男性和女性之间,所有19462个基因中只有12%表达差异,但多达61%的疾病相关基因是性别特异性的。这意味着病理生理学在男性和女性之间存在差异,并且可以解释为什么症状通常出现在青春期后,以及许多性别特异性基...
发布时间: 2019 - 09 - 16
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