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    离子淌度分离概念的引入使得蛋白质组学进入了4D新时代。4D蛋白质组学是在3D分离即保留时间(retention time)、质荷比(m/z)、离子强度(intensity)这三个维度的基础之上增加了第四个维度,离子淌度(mobility)的分离(图1),并大幅度的提高扫描速度和检测灵敏度,带来蛋白质组学在鉴定深度、检测周期、定量准确性等性能的全面提升。图1. 新一代4D蛋白质组学示意图磷酸化是研究最广泛的翻译后修饰类型,在生长发育、信号转导以及包括癌症在内的各种疾病进程中都发挥着至关重要的作用。而随着科学的逐渐深入和技术的不断进步,基于质谱的磷酸化修饰组学也引起了人们越来越多的关注,并有力推动了磷酸化功能研究的进展。然而对于传统的质谱技术来说,要想实现磷酸化的深度和精确鉴定存在着两大挑战,1)生物样品中不同的磷酸化肽段丰度会呈现出几个数量级的差异,这需要更高的质谱扫描速度和灵敏度来鉴定到低丰度的磷酸化肽段;2)同一个肽段发生磷酸化位点的不同,会造成同分异构的磷酸化肽段,并且这些同分异构的磷酸化肽段大部分会在色谱上共洗脱,而传统蛋白组学质谱平台不能对这些共洗脱的同分异构肽段进行分离。现在得益于质谱技术的进步,采用基于Bruker timsTOF Pro平台的4D蛋白质组学技术,这两大问题都得到极大的改善,除了在蛋白质组分析方面展现出的极佳的灵敏度和覆盖深度,根据我...
    2019 - 08 - 06
    近年来,随着技术的不断进步,蛋白质组逐步从方法学研究进入到了实际应用阶段,并在包括精准医学在内的各个研究领域中大放异彩。然而相比技术上更加成熟的基因组和转录组测序而言,蛋白质组学技术在通量、灵敏度和定量可靠性方面仍然有比较明显的差距,而这些差距的根本原因,还是在于蛋白质组的复杂度极高,而质谱仪的分离和检测能力有限。虽然,人们通过一些体外的标记试剂(如TMT/iTRAQ)和采集分析方式(如DIA)试图在有限的硬件能力上做一些改进,但是仍然不能从根本上来解决问题。        令人欢欣鼓舞的是,这个困扰领域多年的问题在近期取得了重大的突破,这就是以新增的“离子淌度“为特征的4D蛋白质组技术的出现。下面,小编就来带着大家扒一扒什么是“4D蛋白质组”,以及4D蛋白质组能够带来哪些改变。 一. 什么是4D基于质谱的蛋白质组学研究,其基本原理主要是通过对被测样品离子的理化性质的测定来进行分析,根据样品的质量谱图和相关信息能够得到定性定量结果。在3D蛋白质组学中,质谱会根据保留时间(retention time)、质荷比(m/z)、离子强度(intensity)这三个维度的性质对肽段离子进行鉴定和定量。4D蛋白质组学则是在3D分离的基础之上增加了第四维度,离子淌度(mobility)的分离(图1)。离子淌度主要根据离子的形状...
    2019 - 05 - 16
    随着组学技术的快速发展,通过多组学数据来解析科学问题已成为趋势,这为动植物和人类遗传分析提供了新机遇。作为蛋白质组学以及蛋白质修饰组学领域的领军企业,为推动多组学数据分析新方法发展,景杰生物携手华中农业大学植物科学技术学院,于2019年5月6-9日开展“多组学数据分析新方法研讨会”,满足广大研究生与青年教师处理多组学海量数据的科研需求。 此次会议邀请美国北卡罗来纳州立大学生物信息研究中心曾昭邦教授、加州大学河滨分校徐士忠教授和贾震宇助理教授、华中农业大学严建兵教授、章元明教授、李林教授、杨万能教授、陈伟教授、王茂军教授和鄢文豪教授等莅临,共同交流多组学技术分析在诸多领域的运用与发展,数百名专家学者齐聚一堂,交流学术知识,碰撞智慧火花,共同推动多组学数据分析新方法新发展。 会议期间,杭州景杰生物科技有限公司CEO程仲毅博士,受邀发表学术报告,带来题为“蛋白组到表型组:运用整合蛋白质组学策略解析植物表型”的精彩报告。报告中,程仲毅博士发布了基于全球顶级质谱仪timsTOF Pro的4D Label-free蛋白质组学技术,并首次公开样本分析数据。   景杰生物一直致力于推动蛋白质组学技术与运用的发展,4D Label-free蛋白质组学技术在检测通量、灵敏度、和检测速度等方面革命性的提升,景杰生物将再度引领蛋白组学高精度分析,进一步突破...
    2019 - 05 - 14
    为加强旱区作物逆境生物学国家重点实验室建设,展现最新科研成果,激发研究生科研热情,5月12日,由景杰生物赞助的旱区逆境生物学国家重点实验室第六届研究生论坛与景杰奖学金评选活动,在西北农林科技大学盛大开幕,100多名师生代表参加此次论坛,中国工程院院士、重点实验室主任康振生等作为论坛嘉宾受邀参加论坛。  康振生院士介绍了旱区作物逆境生物学重点实验室取得的成绩,并从科学研究,人才培养和服务社会的层面强调培养高素质人才的重要性,希望广大科研人员能够充分培养创新意识和科研能力,通过不懈奋斗,获得具有创新性、突破性的科研进展。也希望本次论坛能够进一步促进和推动旱区作物逆境生物学“双一流”学科群建设,为我国旱区农业生产提供更丰富的理论指导与技术支撑。 “景杰奖学金”由杭州景杰生物科技有限公司出资设立,用于奖励旱区作物逆境生物学重点实验室全日制研究生,持续推动旱区作物逆境生物学发展,激发科研热情。经过稿件初选、选手答辩、专家评审等环节,最终园艺学院周坤获得一等奖,植保学院王宁、边瑞玲、许铭、齐朝妹,生命学院李远凤获二等奖,张玉民、胡洋、李卫卫等同学获三等奖。   景杰生物王云龙经理代表景杰生物与西北农林科技大学园艺学院王跃进教授为一等奖获得者颁奖并作简短发言。  “站在巨人的肩膀上,能看得更远。”第一名获奖者周坤表示...
    2019 - 05 - 12
    景杰学术/报道近日,随国际著名分析仪器制造商Bruker全球执行副总裁 Rohan A. Thakur博士的来访,蛋白质组学与修饰组学分析行业领跑者景杰生物(PTM BIO)与Bruker联合宣布:首批全球顶级质谱仪timsTOF Pro正式入驻景杰生物,并开展样本分析工作。这是景杰生物继引进赛默飞Orbitrap系列超高分辨质谱仪-- Orbitrap Fusion和Q Exactive™ HF-X后,再度成为全球顶级质谱仪的首批用户。timsTOF Pro系列质谱仪将和景杰生物原有的Orbitrap系列高端质谱仪实现优势互补,打造业内高规格、高标准的蛋白质质谱仪集群。▲ Bruker全球执行副总裁Rohan A. Thakur博士到访景杰生物(左三:Bruker全球执行副总裁 Rohan A. Thakur博士,左二:景杰生物CEO 程仲毅博士)景杰生物一直致力于推动蛋白质组学技术与运用的发展,依托timsTOF Pro质谱系统检测速度、灵敏度革命性的提升,景杰生物将再度引领蛋白组学高精度分析,进一步突破蛋白质组学研究现有瓶颈,树立行业新标准,加速基础科研和临床领域运用,推动精准医疗的快速发展。▲ 景杰生物为Bruker timsTOF Pro质谱仪中国区首批用户Bruker timsTOF Pro质谱系统Bruker timsTOF Pro质谱仪...
    2019 - 04 - 23
    景杰学术/报道4月9-12日,“中国细胞生物学学会2019年全国学术大会”(CSCB2019)在天津成功举办。作为蛋白质组学、翻译后修饰研究领域的领跑者,景杰生物受邀参会。两大最新技术染色质蛋白质组学(CBP Profiling技术)、PTM Multiplex技术惊艳亮相!修饰抗体6大验证标准,全线升级!为细胞生物学研究领域客户带来从染色质研究,到蛋白质翻译后修饰的表观遗传学整体研究方案。今天,小编就与您分享这些最新进展。(文末有福利!)表观遗传调控,在细胞生物学研究中大有可为会议期间,百余场学术报告与十二场专题论坛围绕表观调控、发育、衰老、干细胞、肿瘤、免疫治疗等热点研究方向,两千余名与会学者共同探讨细胞生物学发展前沿。现任南开大学校长的曹雪涛院士在《免疫炎症反应的表观调控》的大会报告中讲述了hnRNP-A2B1发生去甲基化能够结合tbk1和sting、irf3,激活tbk1-IRF3,从而调控先天免疫与炎症反应。北大医学部张宏权教授在《Src-mediated phosphorylation converts FHL1 from tumor suppressor to promotor.》的报告中讲述了抑癌蛋白(如FHL1)通过多种翻译后修饰变为促癌蛋白,从而促进癌症的发生。诸多研究发现揭示了包括翻译后修饰等在内的表观遗传调控机制在细胞生物学研究中的重要价值。鉴于此,会议期间...
    2019 - 04 - 18
    科技部部长王志刚:“中国科技创新有“三步走”战略,到2020年进入创新型国家,到2035年左右进入创新型国家前列,到2050年要成为世界科技强国。” 3月14日,据CCTV2报道,两会提出要深入实施创新驱动发展战略,特别强调加强重大科技基础设施及科技创新中心的建设,从而保障并提升国家重大科技的基础研究。 新闻中提到,近期国际顶尖学术期刊《Nature》发表的《Proteomics Identifies Therapeutic Targets of Early-tage Hepatocellular Carcinoma》文章引起学术界广泛关注。   该研究由军事科学院军事医学研究院、凤凰中心-国家蛋白质科学中心(北京)、蛋白质组学国家重点实验室贺福初院士团队、钱小红教授团队,与复旦大学附属中山医院樊嘉院士团队等共同完成,本篇文章首次描绘了早期肝细胞癌的蛋白质组表达谱和磷酸化蛋白质组图谱,发现了肝癌精准治疗的新靶点。将有助于目前临床上认为的早期肝细胞癌患者进一步分类诊治。研究人员运用蛋白质组学和磷酸蛋白质组学等技术,针对110个与乙型肝炎病毒感染相关的临床早期肝细胞癌的成对肿瘤和非肿瘤组织进行分析。定量蛋白质组学数据突出了早期肝细胞癌的异质性:将该队列分层为亚型S-I,S-II和S-III,每种亚型具有不同的临床结果。图1. 早期肝癌的...
    2019 - 03 - 05
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